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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 759 个数据集

医学影像病理图像医学图像分割结直肠癌肿瘤学

CRAG — 结直肠腺癌腺体实例分割基准

213 张 H&E 病理图像38 位患者全切片实例级腺体掩码约 2.2 GB PNG免费研究获取（须引用）38 位患者（38 张 WSI 每例 1 张，年龄与性别未公布）

213 张 H&E 病理图像、38 位患者，GlaS 姊妹腺体实例分割基准

University of Warwick TIA Centre（Colorectal Adenocarcinoma Gland Dataset） url: https://warwick.ac.uk/fac/cross_fac/tia/data/mildnet/ 63

图像分类病理图像结直肠癌

MHIST — 结直肠息肉 H&E 组织学二分类

3,152 张 H&E patch224×224 PNGHP vs SSA 二分类约 354 MB免费申请获取未公布（3,152 张 patch 源自 328 张 WSI，患者级信息已脱敏剥离）

3,152 张 7 位病理学家多数投票标注的结直肠息肉 H&E 二分类基准

Dartmouth College BMIRDS & Dartmouth-Hitchcock Medical Center url: https://bmirds.github.io/MHIST/ 51

神经科学公共卫生与流行病学单细胞基因组学

BICCN — 哺乳动物脑细胞普查多模态图谱

数百万细胞 · 多模态跨小鼠狨猴人类运动皮层CC BY 4.0 开放NeMOBILDANDI 档案biccn.org 门户浏览运动皮层细胞普查图谱（细胞级数据，非患者队列）：小鼠/狨猴/人类供体数百万细胞

NIH BRAIN 计划跨物种运动皮层细胞普查图谱 · 数百万细胞 · 多模态

BRAIN Initiative Cell Census Network (BICCN) / BRAIN Cell Data Center (BCDC), Allen Institute url: https://www.biccn.org 55

医学影像CTX光影像COVID-19

BIMCV-COVID19 — 西班牙开放新冠胸片与 CT 影像库

64,089 次影像研究7,918 组 CT21,342 张 CR + 34,829 张 DXDICOMPNGNIfTITSVJSON免费申请获取约 7,944 例患者（COVID+ 4,706 + COVID- 3,238）

64,000+ 影像研究、7,918 组 CT 的开放 COVID-19 胸部影像参考库

Medical Imaging Databank of the Valencian Region (BIMCV), FISABIO-CIPF url: https://bimcv.cipf.es/bimcv-projects/bimcv-covid19/ 50

神经科学公共卫生与流行病学脑影像

ABIDE — 自闭症脑成像多中心联盟开放数据集

约 2,226 个影像数据集539+521 名 ASD 受试者rs-fMRI + T1 + 73 字段表型CC BY-NC-SA 开放获取2,156 名独立受试者（官网口径 2,226 个数据集）

17+19 站点 2,226 个 rs-fMRI/T1 自闭症脑影像开放数据

ABIDE Consortium（NYU Langone / Nathan S. Kline Institute / Child Mind Institute） url: http://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/abide/ 55

电子健康记录公共卫生与流行病学医疗登记临床电子病历流行病学重症监护

Swedish NPR — 瑞典国家患者登记

约 1,050 万人口覆盖约 150 万住院出院年1964 年起住院记录2001 年起专科门诊记录ICD-10-SE 与 KVÅ 编码申请审核获取约 1,050 万人口（瑞典全国居民，个体级链接）

1964 年至今覆盖约 1,050 万人口的瑞典全国住院与专科门诊登记

National Board of Health and Welfare (Socialstyrelsen), Sweden url: https://socialstyrelsen.se/en/statistics-and-data/registers/national-patient-register 63

医学影像CT肺癌

RIDER Lung CT — 重复扫描肺癌 CT 数据

32 例 NSCLC 重复扫描43.01GB DICOM六重建设置CC BY 4.0免费下载32 例患者

32 例 NSCLC 同日双 CT 重复扫描，六重建设置，影像组学可重复性金标准

Memorial Sloan Kettering Cancer Center（经由 The Cancer Imaging Archive） url: https://www.cancerimagingarchive.net/?p=43451 51

医学影像病理图像医学图像分割肿瘤学

PanNuke — 泛癌细胞核实例分割分类

7,901 张 256×256 H&E 图约 18.97 万个标注核19 种组织5 类核三折官方划分CC BY-NC-SA 4.0 非商用patch 级：7,901 张图像（非患者级发布）

19 组织 7,901 图 · 约 18.97 万标注核 · 泛癌细胞核分割分类基准

Tissue Image Analytics (TIA) Centre, University of Warwick url: https://warwick.ac.uk/fac/cross_fac/tia/data/pannuke 86

医学影像X光影像图像分类COVID-19

COVID-19 放射学影像 — 多源聚合胸部 X 光库

约 21,165 张 CXR 图像四类 + 肺分割掩膜PNG 白底 299×299约 1.15 GBKaggle 免费下载多源聚合图像级（21,165 张 CXR，无患者级标识与去重）

Kaggle 多源聚合 COVID CXR · 21,165 张 · 四分类

Kaggle — Tawsifur Rahman（卡塔尔大学 / 达卡大学团队） url: https://www.kaggle.com/datasets/tawsifurrahman/covid19-radiography-database 60

生理信号医学问答与基准心电信号心血管疾病评测基准

MIT-BIH AFDB — 房颤长时程心电数据库

25 例 × 10 小时长程记录250 Hz12-bit 双导联约 440MB（ZIP）人工节律注释免认证直接下载ODC-By 1.025 名房颤患者

房颤检测算法的开山基准 · 25 例 × 10 小时双导联 ECG · 免认证开放

MIT & Beth Israel Hospital（PhysioNet） url: https://physionet.org/content/afdb/ 83

生理信号可穿戴传感帕金森病时序数据疾病监测

Daphnet FoG — 帕金森冻结步态检测

20.5 MB 压缩包（UCI 直接下载）10 例患者 17 段录音237 次 FoG 事件标注8 小时 20 分连续记录9 通道 64 Hz 加速度10 例帕金森病患者（其中 8 例出现冻结步态）

10 例患者、237 次冻结事件、8 小时 20 分 9 通道可穿戴加速度金标注基准

UCI Machine Learning Repository（采集方：特拉维夫 Sourasky 医学中心与 ETH Zurich） url: https://archive.ics.uci.edu/dataset/245/daphnet+freezing+of+gait 62

基因组学与多组学表观基因组测序数据

Roadmap Epigenomics — 人类参考表观基因组图谱

127 个整合参考表观基因组2,805 个基因组范围数据集1,502 亿条测序 reads15 状态 ChromHMM 注释免费开放无需注册非患者数据（健康人原代细胞、组织与干细胞系样本）

127 个整合参考表观基因组，2,805 个基因组范围数据集

NIH Roadmap Epigenomics Mapping Consortium（WashU Ting Wang 实验室托管数据门户） url: https://egg2.wustl.edu/roadmap/web_portal/ 47

定制数据集服务

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