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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 759 个数据集

医学影像病理图像乳腺影像图像分类肿瘤学乳腺癌

BACH — 乳腺癌组织学图像挑战赛数据集

约 13.4 GB（Zenodo 两包）500 张显微图像 + 40 张 WSI四分类完全均衡像素级 WSI 标注CC BY-NC-NDZenodo 免费下载500 张显微图像 + 40 张全切片

ICIAR 2018 乳腺癌组织学挑战赛 · 500 张 H&E 显微图像 + 40 张 WSI

INESC TEC & i3S（IPATIMUP/INEB），葡萄牙波尔图大学 url: https://iciar2018-challenge.grand-challenge.org/ 124

医学影像公共卫生与流行病学COVID-19X光影像

MIDRC-RICORD — RSNA 新冠开放影像数据库

约 32.6 GB DICOM 影像588 例患者240 例胸部 CT998 张新冠阳性胸片MD.ai JSON 专家标注CC BY-NC 4.0588 例患者（1A 110 例 + 1B 117 例 + 1C 361 例）

RSNA 与 STR 多国专家标注新冠胸片与 CT 开放库，1,238 项检查

RSNA / MIDRC 联盟（NIBIB 资助），TCIA 托管 url: https://www.rsna.org/covid-19/covid-19-ricord 69

医学影像眼科影像医学图像分割皮肤影像骨骼肌肉影像

CHASE_DB1 — 儿童视网膜血管分割基准

28 幅儿童眼底图像56 幅人工血管掩膜999×960 JPGPNG约 2.4 MB ZIPCC BY 4.0 开放获取14 名儿童（双眼 28 幅图像）

28 幅儿童眼底图像 × 双观察者标注的视网膜血管分割参考基准

Kingston University London 与 St George's, University of London url: https://researchinnovation.kingston.ac.uk/en/datasets/chasedb1-retinal-vessel-reference-dataset-4 72

医学影像眼科影像图像分类

RFMiD — 视网膜多病种眼底图像数据集

3,200 张眼底彩照45+ 病种多标签CC-BY 4.0竞赛托管获取3,200 张眼底图像（图像级，非独立患者计数）

3,200 张眼底彩照 · 45+ 病种多标签标注 · 罕见病长尾筛选

RIADD Grand Challenge (Grand Challenge in Biomedical Image Analysis) url: https://riadd.grand-challenge.org/ 75

医学影像手术视频眼科影像

CATARACTS — 白内障手术视频基准

50 台白内障手术117.8 GB Full HD 视频21 类器械逐帧标注18+1 类手术阶段标注免费开放获取50 名白内障患者（38 女 / 12 男，平均 61 岁）

50 台白内障手术、9 小时 Full HD 显微镜视频、21 类器械与 18 类手术阶段逐帧标注

布雷斯特大学医院（CHU de Brest）× LaTIM / Inserm UMR 1101 url: https://ieee-dataport.org/open-access/cataracts 62

医学影像病理图像医学图像分割结直肠癌肿瘤学

CRAG — 结直肠腺癌腺体实例分割基准

213 张 H&E 病理图像38 位患者全切片实例级腺体掩码约 2.2 GB PNG免费研究获取（须引用）38 位患者（38 张 WSI 每例 1 张，年龄与性别未公布）

213 张 H&E 病理图像、38 位患者，GlaS 姊妹腺体实例分割基准

University of Warwick TIA Centre（Colorectal Adenocarcinoma Gland Dataset） url: https://warwick.ac.uk/fac/cross_fac/tia/data/mildnet/ 63

图像分类病理图像结直肠癌

MHIST — 结直肠息肉 H&E 组织学二分类

3,152 张 H&E patch224×224 PNGHP vs SSA 二分类约 354 MB免费申请获取未公布（3,152 张 patch 源自 328 张 WSI，患者级信息已脱敏剥离）

3,152 张 7 位病理学家多数投票标注的结直肠息肉 H&E 二分类基准

Dartmouth College BMIRDS & Dartmouth-Hitchcock Medical Center url: https://bmirds.github.io/MHIST/ 51

医学影像医学问答与基准X光影像结核病评测基准

Montgomery CXR — 肺结核 X 光基准集

- "138 张 PA 胸片（单张 2.1-7.2 MB）" - "80 正常58 结核" - "12-bit PNG 约 0.6 GB" - "左右肺手工掩膜各 138 张" -138 名受检者（按影像计）

138 张 PA 胸片 + 双肺手工掩膜的肺结核筛查经典基准

name: "美国国家医学图书馆 Lister Hill 生物医学传播中心（LHNCBC, NLM/NIH）" url: "https://www.lhncbc.nlm.nih.gov/LHC-publications/pubs/TuberculosisChestXrayDatasets.html" 91

神经科学公共卫生与流行病学单细胞基因组学

BICCN — 哺乳动物脑细胞普查多模态图谱

数百万细胞 · 多模态跨小鼠狨猴人类运动皮层CC BY 4.0 开放NeMOBILDANDI 档案biccn.org 门户浏览运动皮层细胞普查图谱（细胞级数据，非患者队列）：小鼠/狨猴/人类供体数百万细胞

NIH BRAIN 计划跨物种运动皮层细胞普查图谱 · 数百万细胞 · 多模态

BRAIN Initiative Cell Census Network (BICCN) / BRAIN Cell Data Center (BCDC), Allen Institute url: https://www.biccn.org 55

医学影像CTX光影像COVID-19

BIMCV-COVID19 — 西班牙开放新冠胸片与 CT 影像库

64,089 次影像研究7,918 组 CT21,342 张 CR + 34,829 张 DXDICOMPNGNIfTITSVJSON免费申请获取约 7,944 例患者（COVID+ 4,706 + COVID- 3,238）

64,000+ 影像研究、7,918 组 CT 的开放 COVID-19 胸部影像参考库

Medical Imaging Databank of the Valencian Region (BIMCV), FISABIO-CIPF url: https://bimcv.cipf.es/bimcv-projects/bimcv-covid19/ 50

神经科学公共卫生与流行病学脑影像

ABIDE — 自闭症脑成像多中心联盟开放数据集

约 2,226 个影像数据集539+521 名 ASD 受试者rs-fMRI + T1 + 73 字段表型CC BY-NC-SA 开放获取2,156 名独立受试者（官网口径 2,226 个数据集）

17+19 站点 2,226 个 rs-fMRI/T1 自闭症脑影像开放数据

ABIDE Consortium（NYU Langone / Nathan S. Kline Institute / Child Mind Institute） url: http://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/abide/ 55

电子健康记录公共卫生与流行病学医疗登记临床电子病历流行病学重症监护

Swedish NPR — 瑞典国家患者登记

约 1,050 万人口覆盖约 150 万住院出院年1964 年起住院记录2001 年起专科门诊记录ICD-10-SE 与 KVÅ 编码申请审核获取约 1,050 万人口（瑞典全国居民，个体级链接）

1964 年至今覆盖约 1,050 万人口的瑞典全国住院与专科门诊登记

National Board of Health and Welfare (Socialstyrelsen), Sweden url: https://socialstyrelsen.se/en/statistics-and-data/registers/national-patient-register 63

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