24周2k1c与cont24w的肾脏损伤数据集

主题标签:肾脏损伤、泌尿生殖系统疾病、2k1c模型、24周、转录组。本站分类:泌尿生殖系统疾病。本数据集为泌尿生殖系统疾病领域公开数据集,主题涵盖肾脏损伤。

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基因组分类肾脏损伤泌尿生殖系统疾病2k1c模型24周转录组
renal damage in 24w2k1c v cont24w

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

24周2k1c与cont24w的肾脏损伤数据集

renal damage in 24w2k1c v cont24w 是一个公开的转录组数据集,主题聚焦于肾脏损伤,属于泌尿生殖系统疾病领域。该数据集以 2k1c 模型与 24 周时间点为核心线索,用于比较模型组与对照组在肾脏损伤相关基因表达层面的差异。数据集来源于 ebi.ac.uk,原始记录由 Trude Skogstrand 于 2014 年提交,可通过 ArrayExpress 平台以 E-MTAB-1449 编号访问。整体而言,该数据集为研究肾脏损伤的分子机制、筛选差异表达基因以及探索 2k1c 模型长期进展过程中的转录组变化提供了公开可用的实验数据基础。

【数据集背景】

肾脏损伤是泌尿生殖系统疾病研究中的重要议题,涉及多种病理过程与分子通路的改变。2k1c(两肾一夹)是肾性高血压及肾脏损伤研究中常用的实验模型,而 24 周的时间点通常对应较长期的病程观察。该数据集正是在这一研究背景下产生,旨在通过转录组层面的检测,刻画 24 周时 2k1c 模型与对照条件之间肾脏损伤相关基因表达的特征。数据集的英文名称直接体现了“renal damage”“24w”“2k1c”与“cont24w”等关键要素,表明其设计围绕模型组与对照组的比较展开。

【数据内容】

该数据集属于转录组数据,主题标签涵盖肾脏损伤、泌尿生殖系统疾病、2k1c 模型、24 周与转录组。其核心内容为肾脏损伤相关的基因表达谱信息,可用于比较 2k1c 模型与对照在 24 周时的转录组差异。关于样本数量、分组细节、检测平台、基因数量及具体表达矩阵的规模,源站未提供。数据集在本站归类于泌尿生殖系统疾病 / 其他,属于该领域公开数据集之一。

【采集与来源】

数据集来源站为 ebi.ac.uk,原始记录为 Trude Skogstrand(2014)提交的 “renal damage in 24w2k1c v cont24w”,访问地址为 https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-1449/。该记录托管于 ArrayExpress 实验数据库,采用 E-MTAB-1449 作为实验编号。关于具体的动物品系、造模手术细节、组织取材方式、RNA 提取与测序或芯片杂交流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肾脏损伤相关的转录组研究场景,包括但不限于:比较 2k1c 模型与对照在 24 周时的基因表达差异;筛选与肾脏损伤进展相关的候选基因与通路;作为泌尿生殖系统疾病领域公开数据的补充资源,用于方法学比较或结果验证;以及为肾性高血压与肾脏损伤长期病程的分子机制研究提供数据参考。具体适用性仍需结合使用者自身的研究设计与分析目标判断。

【使用方法】

使用者可通过 ArrayExpress 平台以 E-MTAB-1449 编号检索并获取该数据集。常见的使用方式包括下载原始数据或处理后数据,开展差异表达分析、功能富集分析及通路层面的比较研究。由于源站未提供样本分组、平台与数据格式等细节,具体分析流程与预处理步骤需依据实际下载到的数据内容确定。

【质量与限制】

该数据集为公开提交的转录组数据,其质量与限制取决于原始实验设计与数据处理过程。源站未提供样本量、重复数、测序深度或芯片质控指标等信息,因此无法对数据质量作出具体评价。使用时应关注模型与对照的可比性、时间点的一致性以及转录组数据本身的噪声与批次效应等问题。此外,该数据集仅覆盖 24 周这一时间点,跨时间点的动态变化需结合其他数据加以推断。

【引用与许可】

引用该数据集时,应参照源站记录:Trude Skogstrand (2014). renal damage in 24w2k1c v cont24w [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-1449/。关于该数据集的具体许可条款与使用限制,源站未提供。

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源站:https://ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-1449

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Trude Skogstrand (2014). renal damage in 24w2k1c v cont24w [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-1449/

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