TCGA-TGCT影像数据集合
IDC整理的TCGA睾丸生殖细胞肿瘤影像集合,可与TCGA基因组和临床数据匹配,适合影像组学和多模态研究。

基本信息
资源简介
TCGA-TGCT影像数据集合
【一句话概览】
TCGA-TGCT 数据集聚焦睾丸生殖细胞肿瘤。此类癌症多起源于睾丸内可发育为精子的生殖细胞,可分为精原细胞瘤与非精原细胞瘤,后者通常生长和扩散更快,混合两种亚型者归为非精原细胞瘤。该癌症较罕见,占男性所有肿瘤的 1-2%,却是 15 至 35 岁男性中最常见的癌症,发病率在包括欧洲和美国在内的许多国家持续上升。白人男性、隐睾、睾丸发育异常或有家族史者风险更高。该病治疗效果好。数据集受试者数为 150,标签涉及睾丸生殖细胞、睾丸、SM、SEG 及人类(来源 portal.imaging.datacommons.cancer.gov)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《TCGA-TGCT》。
【数据内容】
源站原始描述:More than 90% of testicular cancer start in the germ cells, which are cells in the testicles and develop into sperm. This type of cancer is known as testicular germ cell cancer. Testicular germ cell cancer can be classified as either seminomas or nonseminomas, which may be identified by microscopy. Nonseminomas typically grow and spread more quickly than seminomas. A testicular germ cell tumor that contains a mix of both these subtypes is classified as a nonseminoma. TCGA studied both seminomas…
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):超过90%的睾丸癌起源于生殖细胞,即睾丸内发育成精子的细胞。这类癌症被称为睾丸生殖细胞癌。睾丸生殖细胞癌可分为精原细胞瘤和非精原细胞瘤,可通过显微镜检查进行鉴别。非精原细胞瘤通常比精原细胞瘤生长和扩散得更快。含有这两种亚型混合成分的睾丸生殖细胞肿瘤被归类为非精原细胞瘤。TCGA对精原细胞瘤和非精原细胞瘤均进行了研究。睾丸生殖细胞癌较为罕见,占男性所有肿瘤的1-2%。然而,它是15至35岁男性中最常见的癌症。在许多国家,包括欧洲和美国,睾丸生殖细胞癌的发病率持续上升。2013年,估计约有8,000名美国男性被诊断患有该癌症。其中,预计370人将死于该疾病。白人男性、患有隐睾、睾丸发育异常或有睾丸癌家族史的男性患睾丸癌的风险更高。幸运的是,睾丸生殖细胞癌高度可治。请查看TCGA-TGCT集合页面的DICOM转换幻灯片显微镜图像,以了解更多关于组织病理学图像的信息,并获取该集合的任何支持性元数据。
【主题与分类】
主题标签:Testicular Germ Cell、Testicles、SM、SEG、Human。
【适用方向】
影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。
【获取与许可】
源站页面:https://portal.imaging.datacommons.cancer.gov/collections/tcga_tgct/
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://portal.imaging.datacommons.cancer.gov/collections/tcga_tgct/
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
IDC整理的TCGA睾丸生殖细胞肿瘤影像集合,可与TCGA基因组和临床数据匹配,适合影像组学和多模态研究。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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