DIPG蛋白组数据

DIPG proteomics PXD053094 面向弥漫性内生性桥脑胶质瘤及相关疾病研究,提供可公开访问的表格数据或临床/组学信息,适合用于分类、生物标志物探索、队列比较和算法验证等研究场景。

EMBL-EBIEMBL-EBI
PRIDE
2024-01-01 更新
浏览 33
表格分类HumanDiffuse intrinsic pontine gliomaDIPGLC-MSMSBrain cancerHomo sapiensProteomicsBottom-up proteomicsQ Exactive HFMaxQuant
DIPG proteomics PXD053094

基本信息

模态
表格
任务类型
分类
创建/更新时间
2024-01-01

资源简介

DIPG蛋白组数据

【一句话概览】

弥漫内生型脑桥胶质瘤(DIPG)是一种由H3K27M致癌组蛋白驱动的致死性儿童癌症,表现出异常的表观遗传调控和干细胞样细胞状态。该研究揭示了涉及H3.3K27M致癌组蛋白与CREB5/ID1的一条轴线,其维持DIPG细胞的干细胞样状态并促进恶性进展,并证明CREB5在H3.3K27M/ACVR1WT亚型中介导ID1水平升高。数据采用LC-MSMS、自下而上蛋白质组学、Q Exactive HF和MaxQuant,物种为人类(来源 ebi.ac.uk)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Human diffuse intrinsic pontine glioma (DIPG) LC-MSMS》。

【数据内容】

源站原始描述:Diffuse intrinsic pontine glioma (DIPG), a lethal pediatric cancer driven by H3K27M oncohistones, exhibits aberrant epigenetic regulation and stem-like cell states. Here, we uncover an axis involving H3.3K27M oncohistones, CREB5/ID1, which sustains the stem-like state of DIPG cells, promoting malignancy. We demonstrate that CREB5 mediates elevated ID1 levels in the H3.3K27M/ACVR1WT subtype…Read more

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):弥漫性内生性脑桥胶质瘤(DIPG)是一种由H3K27M致癌组蛋白驱动的致死性儿童癌症,表现出异常的表观遗传调控和干细胞样细胞状态。在此,我们揭示了一个涉及H3.3K27M致癌组蛋白、CREB5/ID1的轴,该轴维持DIPG细胞的干细胞样状态,促进恶性进展。我们证明CREB5在H3.3K27M/ACVR1WT亚型中介导ID1水平升高……阅读更多

【主题与分类】

主题标签:Human、Diffuse intrinsic pontine glioma、DIPG、LC-MSMS、Brain cancer、Homo sapiens、Proteomics、Bottom-up proteomics、Q Exactive HF、MaxQuant。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD053094

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源站:https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD053094

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DIPG proteomics PXD053094 是与弥漫性内生性桥脑胶质瘤相关的公开数据集,涵盖表格数据,可用于分类、疾病表型分析或模型评估。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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