人类牙周炎整合单细胞图谱

资源简介

人类牙周炎整合单细胞图谱

An Integrated Single Cell Atlas of Human Periodontitis 是一个面向人类牙周炎研究的单细胞转录组整合数据集。该数据集利用四个公开可获取的人类组织样本数据集，涵盖健康、牙龈炎与牙周炎三种疾病状态，构建了首个牙周炎整合单细胞图谱草稿。其组织来源为牙龈，检测平台包括 10x 3' v2 与 10x 3' v3 两种单细胞测序方案。数据集以单细胞分辨率呈现牙龈组织在正常、牙龈炎和牙周炎状态下的细胞组成信息，主题标签对应牙龈炎、正常和牙周炎。该资源托管于 CZ CELLxGENE 平台，属于口颌系统疾病领域的单细胞数据集，可为牙周疾病的细胞异质性研究提供整合性参考。

【数据集背景】

牙周疾病包括牙龈炎和牙周炎，是影响口颌系统健康的常见疾病。传统批量组织转录组分析难以揭示牙龈组织中不同细胞类型在疾病状态下的异质性变化。单细胞测序技术的发展使得在单个细胞水平上解析组织组成和状态成为可能。然而，公开的单细胞牙周研究数据分散于不同来源，缺乏统一整合的参考图谱。该数据集正是针对这一需求，利用四个公开的人类健康、牙龈炎与牙周炎组织样本数据集，构建了首个牙周炎整合单细胞图谱草稿，旨在为牙周疾病的细胞层面研究提供整合性资源。

【数据内容】

该数据集覆盖的疾病状态包括牙龈炎、正常和牙周炎三类。组织类型为牙龈。检测平台为 10x 3' v2 与 10x 3' v3。数据集以单细胞数据集形式呈现，托管于 CZ CELLxGENE。主题标签对应牙龈炎、正常和牙周炎。数据集整合了四个公开的人类组织样本数据集，形成整合后的单细胞图谱草稿。关于具体细胞类型注释、细胞数量、基因数量、聚类结果等详细信息，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 cellxgene.cziscience.com，属于 CZ CELLxGENE 平台上的单细胞数据集。其构建基于四个公开可获取的人类健康、牙龈炎与牙周炎组织样本数据集。原始样本的组织类型为牙龈，疾病状态涵盖牙龈炎、正常和牙周炎。检测平台为 10x 3' v2 与 10x 3' v3。关于样本采集地点、供者数量、伦理审批信息、原始数据的具体来源数据库等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于牙周疾病相关的单细胞水平研究。具体而言，可用于探索牙龈组织在正常、牙龈炎和牙周炎状态下的细胞组成差异，识别与疾病状态相关的细胞类型或细胞状态变化，以及作为牙周炎单细胞分析的整合参考图谱。由于覆盖三种疾病状态并整合了多个公开数据集，该资源也可用于跨数据集的比较分析或作为方法学验证的参考。关于该数据集在特定分析流程中的验证结果或基准性能，源站未提供。

【使用方法】

该数据集托管于 CZ CELLxGENE 平台，用户可通过该平台访问。关于具体的数据下载格式、文件结构、分析工具接口、是否需要注册或登录、是否有配套的分析教程或代码示例等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为整合单细胞图谱草稿，基于四个公开数据集构建。关于数据质量控制指标、批次效应校正方法、细胞过滤标准、整合算法的具体参数、数据完整性评估等信息，源站未提供。作为草稿版本，其覆盖范围和注释深度可能随后续更新而变化，但源站未提供相关更新计划或版本说明。

【引用与许可】

关于该数据集的引用格式、许可协议、使用限制、商业使用条件等信息，源站未提供。