人类皮肤单细胞转录组揭示成纤维细胞 priming 随年龄下降

数据集获取

源站：https://cellxgene.cziscience.com/collections/c353707f-09a4-4f12-92a0-cb741e57e5f0

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

成纤维细胞是维持人类皮肤结构和功能的 essential 细胞群体。尽管成纤维细胞的异质性已得到充分证实，但这一现象尚未被系统分析。我们采用单细胞RNA测序技术，分析了来自健康人类供体防晒部位超过5，000个成纤维细胞的转录组。我们的结果定义了四个主要亚群，这些亚群在空间上可定位，并显示出不同的分泌、间充质和促炎功能注释。重要的是，我们发现这种成纤维细胞的“预置”状态随年龄增长而减少。我们还表明，衰老导致真皮成纤维细胞与其他皮肤细胞之间预测相互作用的显著减少，包括位于真皮-表皮交界处的未分化角质形成细胞。因此，我们的工作为人类真皮成纤维细胞的功能特化提供了证据，并将细胞身份的部分丧失确定为人类真皮中一个重要的年龄相关变化。这些发现对于理解人类皮肤衰老及其相关表型具有重要意义。疾病：正常。组织：皮肤区域。检测方法：10x 3’ v2。

Single-cell dataset (CZ CELLxGENE).

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。