炎症性皮肤病中发育细胞程序的重新启用

数据集获取

源站：https://cellxgene.cziscience.com/collections/73f82ac8-15cc-4fcd-87f8-5683723fce7f

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

皮肤通过胚胎发育早期建立的复杂细胞网络提供生物物理和免疫保护。我们对来自发育中的人类胎儿皮肤、健康成人皮肤以及患有特应性皮炎和银屑病的成人皮肤的50多万个单细胞进行了转录组分析。我们利用这些数据集比较了发育、稳态和疾病状态下的细胞状态。我们的分析揭示了在妊娠早期皮肤中先天免疫细胞的富集，以及特应性皮炎和银屑病中疾病相关淋巴细胞的克隆扩增。我们发现在特应性皮炎和银屑病皮损皮肤中，产前血管内皮细胞和巨噬细胞细胞程序重新出现，并在原位进行了验证。这些数据说明了皮肤免疫的动态性，并为靶向炎症性皮肤疾病中的病理性发育程序提供了机会。疾病：正常。组织：真皮、皮肤表皮。检测方法：10x 3‘ v2。单细胞数据集（CZ CELLxGENE）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。