健康与寻常型银屑病成人皮肤细胞

该数据集来自 CZ CELLxGENE,包含健康供体与寻常型银屑病患者的全层皮肤样本,共 3 例患者皮损区与 3 例健康供体对应区域,采用 10x Genomics(V3.1)进行单细胞 RNA 测序

cellxgene
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基因组分类normalpsoriasis
Adult human skin cells of health and psoriasis vulgaris

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

健康与寻常型银屑病成人皮肤细胞

该数据集英文名为 Adult human skin cells of health and psoriasis vulgaris,收录于 CZ CELLxGENE 平台,属于皮肤疾病领域的单细胞转录组数据。其核心目的在于探索人类寻常型银屑病在细胞与分子层面的改变。研究采集了 3 例银屑病患者皮损区域的全层皮肤样本,以及 3 例健康供体对应区域的可比样本,并采用 10x Genomics(V3.1)平台进行单细胞 RNA 测序。通过覆盖全层皮肤的单细胞转录图谱,该数据集为理解银屑病中不同皮肤细胞类型之间的免疫调控提供了独特视角。数据集涵盖的疾病状态包括正常与银屑病,组织来源为躯体皮肤,检测方法为 10x 3' v3,主题标签为 normal 与 psoriasis。

【数据集背景】

银屑病是一种涉及免疫系统异常活化的慢性炎症性皮肤病,寻常型银屑病是其常见类型。为在细胞和分子水平上系统解析该疾病的改变,该数据集聚焦于患者皮损区域与健康对照皮肤之间的转录差异。通过单细胞 RNA 测序,研究者能够从全层皮肤中分辨不同细胞类型的表达特征,进而观察免疫调控在不同皮肤细胞群体中的表现。该数据集由 CZ CELLxGENE 平台收录,属于皮肤疾病分类下的单细胞数据集。

【数据内容】

该数据集包含来自 3 例寻常型银屑病患者皮损区域的全层皮肤样本,以及来自 3 例健康供体对应区域的可比样本。疾病状态涵盖正常与银屑病两类,组织类型为躯体皮肤。所有样本均通过 10x Genomics(V3.1)平台进行单细胞 RNA 测序,检测类型为 10x 3' v3。数据集提供了人类银屑病全层皮肤的转录景观,可用于观察不同皮肤细胞类型之间的免疫调控关系。主题标签为 normal 和 psoriasis。

【采集与来源】

样本采集自 3 例银屑病患者的皮损区域和 3 例健康供体的对应区域,均为全层皮肤样本。采集后使用 10x Genomics(V3.1)进行单细胞 RNA 测序。数据来源站为 cellxgene.cziscience.com,属于 CZ CELLxGENE 平台收录的单细胞数据集。源站描述中未提供更具体的采集地点、时间、伦理审批或供体人口学信息。

【适用场景】

该数据集适用于探索人类寻常型银屑病中细胞与分子层面的改变,尤其是全层皮肤范围内不同细胞类型之间的免疫调控研究。由于同时包含银屑病皮损与健康对照样本,可用于比较两类状态下皮肤细胞转录谱的差异。其单细胞分辨率有助于在细胞类型层面分析疾病相关变化,适合作为银屑病皮肤免疫微环境研究的参考数据。

【使用方法】

该数据集为单细胞 RNA 测序数据集,检测平台为 10x Genomics(V3.1),检测类型为 10x 3' v3。使用者可依据 CZ CELLxGENE 平台的一般数据访问与处理方式获取和利用该数据集。源站未提供具体的下载格式、分析流程或代码示例。

【质量与限制】

该数据集样本量较小,包含 3 例银屑病患者皮损样本与 3 例健康供体对应样本。源站未提供细胞数量、测序深度、质控指标或批次信息。由于样本来自特定区域的全层皮肤,且未提供供体人口学与临床细节,结果的外推需谨慎。源站未提供其他质量与限制说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的具体引用文献、许可条款或使用限制。使用者应参考 CZ CELLxGENE 平台的相关规定进行引用与使用。

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使用方式

数据集获取

源站:https://cellxgene.cziscience.com/collections/b1fd6a09-eb76-44ca-822d-68318548094c

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为了探究人类银屑病的细胞和分子改变,我们采集了3名患者病变区域的全层皮肤样本以及3名健康供者的相应区域样本。这些样本使用10x Genomics(V3.1)进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)。人类银屑病全层皮肤的转录图谱为不同皮肤细胞类型之间的免疫调节提供了独特视角。疾病:正常、银屑病。组织:躯体皮肤。检测方法:10x 3’ v3。单细胞数据集(CZ CELLxGENE)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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