空间蛋白质组学与转录组学揭示晚期蕈样肉芽肿和Sézary综合征的分子亚型及生物标志物
该数据集整合了皮肤T细胞淋巴瘤(包括晚期蕈样肉芽肿和Sézary综合征)患者组织样本的空间蛋白质组学和转录组学数据,包含基因表达和蛋白质分布的多模态空间测量信息,主要用于疾病分子亚型鉴定、多组学生物标志物发现以及推动精准医疗研究。

基本信息
资源简介
空间蛋白质组学与转录组学揭示晚期蕈样肉芽肿和Sézary综合征的分子亚型及生物标志物
【一句话概览】
该数据集围绕晚期蕈样肉芽肿与Sezary综合征,采用空间蛋白质组学和转录组学,旨在揭示分子亚型与生物标志物。共含37个文件,源站标签涉及晚期蕈样肉芽肿、Sezary综合征、蛋白质组学及Homo sapiens(9606)(来源 iProX)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Spatial proteomics and transcriptomics reveal molecule subtypes and biomarkers of advanced mycosis fungoides and Sezary syndrome》。
【数据内容】
源站原始描述:Spatial proteomics and transcriptomics reveal molecule subtypes and biomarkers of advanced mycosis fungoides and Sezary syndrome
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):空间蛋白质组学和转录组学揭示晚期蕈样肉芽肿和塞扎里综合征的分子亚型及生物标志物
【数据结构与技术规格】
文件数 37 个。
【主题与分类】
主题标签:Homo sapiens、9606。
【获取与许可】
源站页面:https://www.iprox.cn/page/project.html?id=IPX0015765000
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.iprox.cn/page/project.html?id=IPX0015765000
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个整合了空间蛋白质组学和转录组学数据的医学研究数据集,旨在揭示晚期蕈样肉芽肿(mycosis fungoides)和Sézary综合征(Sézary syndrome)这两种皮肤T细胞淋巴瘤的分子亚型及潜在生物标志物。数据集包含来自患者组织样本的空间多组学测量数据,通过高通量技术(如空间转录组测序和蛋白质组成像)构建,提供了基因表达和蛋白质分布的时空信息。主要研究方向包括皮肤T细胞淋巴瘤的分子分型、多组学生物标志物的发现,以及为疾病机制理解和精准治疗策略开发提供数据支持。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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