犬类特应性皮炎数据集
该数据集包含犬类特应性皮炎的基因型数据，以PLINK格式存储，涵盖了五种犬只品种（包括金毛寻回犬、拉布拉多犬等）的基因型信息，数据经过质量控制和亲缘关系过滤，并配有协变量文件，主要用于研究犬类特应性皮炎的遗传机制、开展基因关联分析以及支持兽医基因组学领域的疾病模型构建。
基本信息
资源简介
犬类特应性皮炎数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Canine atopic dermatitis datasets》。源站首次发布：2022-11-09。
【数据内容】
源站原始描述：The datasets consists of genotype data from dogs in plink format. ATOPYK2 plink files contains genotype data from five dog breeds with and without atopic dermatitis. The ATOPYK2 datafiles were used for imputation. These are pre-QC:ed with the following plink settings maf 0.001 geno 0.05 mind 0.05 #We recommend a second qc before doing the imputation. The imputation was then run per chromosome so for redoing the imputation, as was done in the publication to which this data is connected, use…
主表 ATOPYK2.bim 含 6 列、样本前 2000 行结构完整。
【数据结构与技术规格】
文件数 13 个，合计 50.13 MB。ATOPYK2.bim：text/plain，3.39 MB。ATOPYK2.fam：text/plain，29.39 KB。数据集 DOI：10.17044/scilifelab.21287139.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Gene mapping。主题标签：canine atopic dermatitis。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。源站学科分类标注为 Gene mapping。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.scilifelab.se/articles/dataset/Canine_atopic_dermatitis_datasets/21287139
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Tengvall, Katarina (2022). Canine atopic dermatitis datasets. Uppsala University. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2025-01-15，引用时请注意版本时效。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（Figshare）
源站：https://figshare.com/articles/dataset/Canine_atopic_dermatitis_datasets/21287139
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集包含犬类特应性皮炎的基因型数据，以PLINK格式存储。数据来源于五种不同品种的犬只（包括患有和未患特应性皮炎的个体），主要用于基因型填充和关联分析。数据集分为原始ATOPYK2文件（经过初步质量控制，如MAF≥0.001、基因型缺失率≤0.05）和填充后按品种分割的最终文件（包括金毛寻回犬、拉布拉多犬、德国牧羊犬和西部高地白梗）。每个品种的数据均经过质量控制、亲缘关系过滤，并附有协变量文件（包含对特应性皮炎有显著影响的固定效应）。该数据集适用于犬类遗传病研究、特应性皮炎致病机制分析以及兽医基因组学领域的关联研究。
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