犬特应性皮炎数据集
该数据集为犬类基因型数据,以plink格式存储,包含金毛寻回犬、拉布拉多寻回犬、德国牧羊犬和西部高地白梗等多种犬种患有与未患有特应性皮炎个体的基因型信息,数据经过质量控制和插补处理,主要用于犬类遗传学研究,特别支持特应性皮炎的遗传基础分析和相关生物医学应用。
基本信息
资源简介
该数据集包含犬类基因型数据,采用plink格式存储。核心数据为ATOPYK2 plink文件,涵盖五种犬种(包括患有和未患有特应性皮炎的个体)的基因型信息,用于基因型插补分析。数据集经过初步质量控制(QC),并提供了按染色体分列的插补后数据,这些数据已进一步进行QC和亲缘关系过滤。数据集按犬种细分,包括金毛寻回犬(GR)、拉布拉多寻回犬(LR)、德国牧羊犬(GSD)和西部高地白梗(WHWT),并附有协变量文件(covar-file),其中包含对特应性皮炎性状有显著影响的固定效应。该数据集主要用于犬类遗传学研究,特别关注特应性皮炎的遗传基础分析。
下载信息
注册下载
Tips: 该数据集需要在对应的数据源网站注册通过后,才能进行数据下载,注册有对应要求,或者需要收费。
暂未开放公开下载
Tips: 该数据集属于公开下载,应该可以免费公开下载。
暂未开放有偿下载
Tips: 该数据集 Qianfanghub 可以协助提供有偿下载服务,注意,服务不针对数据相关产权,只是技术服务费。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放千方医数集,医疗数据集部分,是为社区服务的公开医疗数据集搜索引擎,并不存储或者下载原始的任何数据。 如果您有其他医疗数据需求,可以和客服联系,或者下工单。我们有强大的三甲医疗机构帮助您提供个性化的医疗数据定制、采集、标注服务。
使用方式
数据集获取
源站:https://figshare.scilifelab.se/articles/dataset/Canine_atopic_dermatitis_datasets/21287139
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含犬类基因型数据,采用plink格式存储。核心数据为ATOPYK2 plink文件,涵盖五种犬种(包括患有和未患有特应性皮炎的个体)的基因型信息,用于基因型插补分析。数据集经过初步质量控制(QC),并提供了按染色体分列的插补后数据,这些数据已进一步进行QC和亲缘关系过滤。数据集按犬种细分,包括金毛寻回犬(GR)、拉布拉多寻回犬(LR)、德国牧羊犬(GSD)和西部高地白梗(WHWT),并附有协变量文件(covar-file),其中包含对特应性皮炎性状有显著影响的固定效应。该数据集主要用于犬类遗传学研究,特别关注特应性皮炎的遗传基础分析。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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