ABCB5受MITF和β-catenin调控并关联黑色素瘤分化
该数据集包含黑色素瘤中ABCB5基因的表达调控、细胞分化和药物耐药性相关的分子数据，涉及基因表达、转录因子结合和细胞表型等多模态信息，主要用于研究ABCB5在MITF和β-catenin调控下的功能、其在分化细胞中的表达模式以及与非遗传性药物耐药性的关联，为黑色素瘤的细胞状态标记和表型转换机制提供实验依据。
基本信息
资源简介
ABCB5受MITF和β-catenin调控并关联黑色素瘤分化
【数据集背景】
本数据集源站标题为《ABCB5 is activated by MITF and b-catenin and is associated with melanoma differentiation》。源站首次发布：2022-02-20。
【数据内容】
源站原始描述：Defining markers of different phenotypic states in melanoma is important for understanding disease progression, determining the response to therapy, and defining the molecular mechanisms underpinning phenotype-switching driven by the changing intratumor microenvironment. The ABCB5 transporter is implicated in drug-resistance and has been identified as a marker of melanoma-initiating cells. Indeed, ongoing studies are using ABCB5 to define stem cell populations. However, we show here that the ABC…
【主题与分类】
主题标签：ABCB5、MITF、melanoma、stem cells、β-catenin.、ABCB5、MITF、melanoma、stem cells、β-catenin.。
【获取与许可】
源站页面：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=97427ffb334e8186aeb0010857367403
使用许可：openSource。
规范引用：PMID: 31595650
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源站：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=97427ffb334e8186aeb0010857367403
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
该数据集聚焦于黑色素瘤中ABCB5转运蛋白的调控机制及其在细胞分化中的作用。数据包含基因表达、转录调控和细胞表型分析，揭示了ABCB5是MITF转录因子的直接靶点，并受β-catenin信号诱导。研究通过分子生物学实验（如基因表达谱、染色质免疫沉淀等）构建数据，表明ABCB5主要在高分化的黑色素瘤细胞中表达，挑战了其作为去分化干细胞标志物的传统观点。该数据集适用于黑色素瘤细胞分化、药物耐药性机制及肿瘤微环境驱动表型转换的研究。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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