WNT5A通过JAK/STAT通路驱动IL-6依赖性上皮-间质转化在瘢痕疙瘩发病机制中的作用

该数据集包含亚洲人瘢痕疙瘩组织与正常组织的RNA测序数据、博来霉素诱导的小鼠皮肤纤维化动物模型数据以及体外细胞共培养实验数据,涉及基因表达、组织学分析和细胞信号通路等多模态信息,主要用于研究WNT5A基因通过IL-6/JAK/STAT通路驱动上皮-间质转化在瘢痕疙瘩发病机制中的作用,为皮肤纤维化疾病的分子机制探索和靶向治疗开发提供支持。

Yonsei College of MedicineYonsei College of Medicine
干细胞与再生医学数据中心
2022-02-20 更新
浏览 33
人Keloidcontrol转录组
WNT5A Drives IL-6-Dependent Epithelial-to-Mesenchymal Transition via the JAK/STAT Pathway in Keloid Pathogenesis

基本信息

许可
openSource
创建/更新时间
2022-02-20

资源简介

WNT5A通过JAK/STAT通路驱动IL-6依赖性上皮-间质转化在瘢痕疙瘩发病机制中的作用

【数据集背景】

本数据集源站标题为《WNT5A Drives IL-6-Dependent Epithelial-to-Mesenchymal Transition via the JAK/STAT Pathway in Keloid Pathogenesis》。源站首次发布:2022-02-20。

【数据内容】

源站原始描述:Purpose: We aimed to identify the molecular drivers that initiate or sustain keloid pathogenesis.Method: Bulk tissue RNA sequencing of Asian keloid and normal tissues was performed to identify genes that contribute to keloid pathogenesis. We also established a preclinical model of inflammatory skin fibrosis by injecting C57BL/6 mice with bleomycin intradermally for 3 weeks to provide an alternative animal model of keloid scar.Result: Gene set enrichment analysis revealed upregulation of WNT5A ge…

【主题与分类】

主题标签:人、Keloid、control、转录组。

【获取与许可】

源站页面:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=4e5548b6836ab1966ff868a7cde2849d

使用许可:openSource。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集聚焦于瘢痕疙瘩(keloid)的发病机制研究,通过亚洲人瘢痕疙瘩组织与正常组织的RNA测序数据,识别出WNT5A基因表达上调与上皮-间质转化(EMT)相关基因富集。研究还建立了博来霉素诱导的C57BL/6小鼠皮肤纤维化动物模型,模拟瘢痕疙瘩病理过程。体外实验表明,WNT5A激活的成纤维细胞或瘢痕疙瘩成纤维细胞通过分泌IL-6,激活JAK/STAT信号通路,诱导相邻角质形成细胞表达EMT标志物。数据集包含基因表达谱、组织学分析结果及体外共培养实验数据,主要应用于皮肤纤维化疾病、瘢痕疙瘩分子机制及靶向治疗策略的研究。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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