基于初步转录组和ATAC分析揭示的STAT3信号通路在瘢痕疙瘩发病机制中的作用
该数据集包含通过RNA-seq和ATAC-seq技术获得的瘢痕疙瘩成纤维细胞的转录组和表观遗传数据，主要涉及基因表达和染色质可及性等多模态信息，用于研究STAT3、Wnt-β-catenin等信号通路在瘢痕疙瘩发病机制中的作用，并为探索靶向治疗提供分子基础。
基本信息
资源简介
基于初步转录组和ATAC分析揭示的STAT3信号通路在瘢痕疙瘩发病机制中的作用
【数据集背景】
本数据集源站标题为《STAT3 Signaling Pathway in Keloid Pathogenesis Implicated by Preliminary Transcriptome and ATAC Analyses》。源站首次发布：2022-02-20。
【数据内容】
源站原始描述：Keloids are wounding-induced fibroproliferative human tumor–like skin scars of complex genetic makeup and poorly defined pathogenesis. Fibroblasts are the principal mediator of fibroproliferative disorders. To reveal dynamic epigenetic and transcriptome changes of keloid fibroblasts, a vertical study from RNA-seq and ATAC-seq analyses followed by in vivo confirmation of candidate molecule expression and subsequent functional testing was carried out using an early passage, freshly isolated keloid…
【主题与分类】
主题标签：animal model、artificial skin、fibroblasts.、animal model、artificial skin、fibroblasts.、人、Fibroblasts、转录组、基因组。
【获取与许可】
源站页面：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=6b554ff5020feafa48446abc9db8df5a
使用许可：openSource。
规范引用：PMID: 30916811
下载信息
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- OpenDataLab:
数据说明
该数据集聚焦于瘢痕疙瘩（一种伤口诱导的纤维增生性皮肤瘢痕）的发病机制研究。通过RNA-seq和ATAC-seq技术，对早期传代、新鲜分离的瘢痕疙瘩成纤维细胞株及其配对正常对照进行纵向分析，揭示了成纤维细胞在表观遗传和转录组层面的动态变化。数据内容包括转录组测序和染色质可及性测序结果，来源为实验室构建的细胞模型及基于血浆凝块的皮肤等效人源化瘢痕疙瘩动物模型。研究重点涉及肝纤维化、Wnt-β-catenin信号、TGF-β信号、上皮-间质转化（EMT）调控、STAT3信号通路及粘附连接信号等通路，并确认STAT3信号在瘢痕疙瘩成纤维细胞中最为活跃。该数据集主要用于探索瘢痕疙瘩的分子机制，并为靶向STAT3等信号通路的治疗策略提供依据。
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