瘢痕疙瘩疾病中的共生微生物群失调

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256:c09081eab6ba8543c6ebc38b8752c4348ae93f0b9a50ec54a3f0cd9e1aab8549

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集聚焦于瘢痕疙瘩（一种典型的难治性皮肤纤维化疾病），旨在探究共生微生物群与瘢痕组织之间的关联。数据集主要包含两类数据：一是通过16S rRNA测序获取的微生物组数据，包括从患者瘢痕疙瘩表面及邻近正常皮肤表面采集的拭子样本（12对配对样本），以及从手术切除的瘢痕疙瘩组织及其边缘正常组织中获取的深层组织样本（5例患者）；二是批量RNA测序数据，涉及用IL-8和TGF-β处理的人真皮成纤维细胞的转录组数据。数据来源于临床样本采集，采用Illumina Novaseq平台进行测序，并附有用于分析的R脚本。该数据集为研究人类纤维化疾病的病理机制提供了重要资源，尤其关注共生细菌及IL-8信号通路在瘢痕疙瘩复发干预中的潜在靶点价值。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。