α-1抗胰蛋白酶缺乏症患者肝脏SERPINA1基因体细胞逃逸变异筛选数据集

该数据集包含α-1抗胰蛋白酶缺乏症患者肝脏组织的全基因组和外显子组测序数据,主要提供体细胞突变信息(包括单碱基替换和小片段插入缺失)等基因模态数据,用于研究SERPINA1基因中体细胞逃逸变异的选择机制,以深入理解该疾病的分子病理过程并探索潜在的治疗靶点。

Mendeley Data
基因突变分析alpha-1抗胰蛋白酶缺乏症
创建时间2024-12-13
原始链接

https://data.mendeley.com/datasets/vhybvj2g9p

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资源简介

该数据集包含用于支持研究论文《α-1抗胰蛋白酶缺乏症患者肝脏SERPINA1基因体细胞逃逸变异筛选》分析的全基因组和外显子组测序数据。数据集主要包含体细胞突变信息,包括单碱基替换和小片段插入缺失,数据以CSV格式提供(如exome_calls.csv和wgs_calls.csv)。数据列遵循VCF规范,包含基因组位置、参考/变异等位基因、样本ID、聚类ID、变异等位基因频率、突变支持读数、测序深度等关键信息,并包含通过β-二项过度离散过滤算法计算的过度离散参数和q值。基因组坐标基于GRCh38版本构建。该数据集主要用于研究α-1抗胰蛋白酶缺乏症患者肝脏中SERPINA1基因的体细胞突变选择机制,为理解疾病进展和潜在治疗靶点提供基因组学基础。

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影像Selection for somatic escape variants in SERPINA1 in the liver of patients with alpha-1 anti-trypsin deficiency