肺部疾病组织库

研究旨在收集并储存患者接受医生安排的检查后剩余的标本,供肺部科室研究人员日后用于加深对肺部疾病的理解或开发新疗法。典型研究包括对储存的组织、液体或细菌进行细菌培养、炎症标志物测量以及组织特征检查,未来可能开展其他类似检测,但尚未全部确定

Boston Children's HospitalBoston Children's Hospital
clinicaltrials
浏览 7
基因组分类Cystic Fibrosis
Tissue Bank for Pulmonary Diseases

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

肺部疾病组织库

Tissue Bank for Pulmonary Diseases 是一个面向呼吸系统疾病研究的生物样本库数据集,其核心目标是收集并储存患者在接受医生安排的检查后剩余的标本,供肺部科室研究人员日后使用。该数据集在站内被归类为呼吸系统疾病 / 其他,来源站为 clinicaltrials.gov,主题标签为 Cystic Fibrosis。根据源站描述,这些储存的标本将被用于加深对肺部疾病的理解,或用于开发新的治疗方法。典型的研究活动包括对储存的组织、液体或细菌进行细菌培养、炎症标志物测量以及组织特征检查。未来可能开展其他类似检测,但尚未全部确定。需要特别注意的是,该方案明确不会对任何获得的样本进行基因检测。

【数据集背景】

该数据集的建立与呼吸系统疾病研究需求密切相关。源站描述显示,其关注的条件为 Cystic Fibrosis。研究旨在收集和储存患者在接受医生安排的检查后剩余的标本。这些标本并非为研究目的额外采集,而是利用临床诊疗过程中已经产生的剩余材料。通过建立这样的组织库,肺部科室的研究人员可以在日后对这些标本进行系统分析,从而推动对肺部疾病的认识或促进新疗法的开发。该数据集的来源站为 clinicaltrials.gov,站内分类为呼吸系统疾病 / 其他,主题标签为 Cystic Fibrosis。

【数据内容】

该数据集所涉及的内容为患者接受医生安排的检查后剩余的标本,包括组织、液体或细菌。这些标本将被储存,并在日后供研究人员使用。典型的研究操作包括:获取细菌培养、测量炎症标志物以及检查组织特征。源站描述还指出,未来可能进行其他类似检测,但这些检测尚未全部确定。需要强调的是,该方案明确不会对任何获得的样本进行基因检测。因此,数据集的内容范围限定于组织、液体或细菌样本及其相关的细菌培养、炎症标志物测量和组织特征检查,不包含基因检测数据。

【采集与来源】

该数据集的标本来源为患者在接受医生安排的检查后剩余的材料。这些检查由患者的医生安排,研究本身并不额外采集标本,而是收集和储存这些剩余标本。标本类型包括组织、液体或细菌。采集过程与临床诊疗流程相结合,利用已经产生的剩余材料,而非专门为研究目的进行新的侵入性操作。源站描述未提供关于采集时间、采集地点、样本量、储存条件等更详细的信息。

【适用场景】

该数据集适用于肺部科室研究人员开展与肺部疾病相关的研究。典型的研究场景包括:对储存的组织、液体或细菌进行细菌培养,测量炎症标志物,以及检查组织特征。这些研究旨在加深对肺部疾病的理解,或用于开发新的治疗方法。未来可能开展其他类似检测,但尚未全部确定。该数据集不适用于基因检测,因为源站描述明确说明不会对任何获得的样本进行基因检测。适用场景主要围绕呼吸系统疾病,特别是与 Cystic Fibrosis 相关的研究。

【使用方法】

源站描述未提供关于如何使用该数据集的具体说明,包括访问方式、申请流程、数据格式、存储形式等。因此,该部分内容源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的一个明确限制是:不会对任何获得的样本进行基因检测。此外,未来可能开展的检测尚未全部确定,这意味着数据集的具体研究用途存在一定的不确定性。源站描述未提供关于样本质量、数据完整性、存储时长、样本数量、伦理审批状态等质量相关指标。因此,除上述限制外,其他质量与限制信息源站未提供。

【引用与许可】

源站描述未提供关于引用方式、许可条款、使用限制或知识产权等信息。因此,该部分内容源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT00546962

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Conditions: Cystic Fibrosis. The aim of this research study is to collect and store the specimens that are left over after patients undergo tests ordered by their physicians. These specimens will be used at a later time by researchers in the Pulmonary Division to develop a better understanding of pulmonary diseases or for the development of new treatments. Typical research studies that will be conducted on the stored tissue, fluid, or bacteria from the patient sample involve obtaining bacterial cultures, measurement of inflammatory markers, and examination of the characteristics of the tissue. Other similar tests may be done in the future; however, these tests have not all been determined at this time. It is important to note that no genetic testing will be performed on any samples that are obtained as part of this protocol.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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