慢性阻塞性肺疾病患者及频繁急性加重表型的血清代谢组学分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS9119

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：慢性阻塞性肺疾病（COPD）急性加重显著增加发病率和死亡率。COPD的复杂性质给准确预测和理解频繁急性加重带来了挑战。目的：本研究旨在探讨COPD频繁急性加重（COPD-FE）表型的代谢特征，识别与COPD-FE风险相关的潜在代谢生物标志物，并探索其潜在的致病机制。方法：招募了一个由30例稳定期COPD患者组成的内部队列。采用广泛靶向代谢组学方法检测并比较COPD-FE患者与非频繁急性加重（COPD-NE）患者之间的血清代谢物表达。随后，利用生物信息学分析对已识别的代谢物进行通路富集；Spearman相关分析探讨代谢物与临床指标之间的关联，受试者工作特征（ROC）分析评估已识别代谢物的预测性能。一个由20例COPD患者组成的外部队列验证了内部队列的发现。

结果：在检测到的484种代谢物中，有25种在COPD-FE与COPD-NE之间表现出显著差异。代谢组学分析揭示了脂质、能量、氨基酸和免疫通路方面的差异。Spearman相关性分析显示，代谢物与急性加重风险的临床指标之间存在关联。ROC分析显示，D-果糖1,6-二磷酸（AUC=0.871）、精氨酸（AUC=0.836）、L-2-羟基戊二酸（L-2HG，AUC=0.849）、二酰甘油（DG）(16:0/20:5)（AUC=0.827）、DG(16:0/20:4)（AUC=0.818）和肉碱-C18:2（AUC=0.804）的曲线下面积（AUC）值均高于0.8，凸显了它们在两组之间优越的区分能力。外部验证结果显示，DG(16:0/20:5)、DG(16:0/20:4)、肉碱-C18:2和L-2HG在COPD-FE患者与COPD-NE患者之间存在显著差异（p值<0.05）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。