MetaboLights代谢组数据仓库
MetaboLights可检索遗传代谢病相关代谢组研究，适合疾病代谢标志物、质谱数据复用和多组学分析。
基本信息
资源简介
MetaboLights代谢组数据仓库
【一句话概览】
MetaboLights 是一个面向代谢组学实验及其衍生信息的数据库，具有跨物种、跨技术的特点，涵盖代谢物结构及其参考谱图，以及它们的生物学作用、位置和浓度，还包括代谢实验的实验数据。该数据库被多家领先期刊推荐为代谢组学数据存储库（来源 ebi.ac.uk）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《MetaboLights》。
【数据内容】
源站原始描述：MetaboLights is a database for Metabolomics experiments and derived information. The database is cross-species, cross-technique and covers metabolite structures and their reference spectra as well as their biological roles, locations and concentrations, and experimental data from metabolic experiments. MetaboLights is the recommended Metabolomics repository for a number of leading journals
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：MetaboLights是一个用于代谢组学实验及其衍生信息的数据库。该数据库跨物种、跨技术，涵盖了代谢物结构及其参考光谱，以及它们的生物学作用、位置和浓度，还有来自代谢实验的实验数据。MetaboLights是多家领先期刊推荐的代谢组学存储库。
【主题与分类】
主题标签：Metabolomics、Metabolite structures、Reference spectra、Cross-species、Cross-technique、Metabolic experiments。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ebi.ac.uk/metabolights/
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://www.ebi.ac.uk/metabolights/
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
EMBL-EBI维护的开放代谢组学研究数据仓库，包含原始数据和元数据。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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