CF与非CF支气管扩张的区域表型分析

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04793867

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：囊性纤维化、非CF支气管扩张。具体目标1：在肺功能正常但通气异常的CF患者中验证功能成像标志物。研究者假设成像表型能够预测肺功能下降，即使在肺功能正常的CF患者中也是如此。研究者将通过在一组CF患者中每年进行HP 129Xe通气MRI来检验这一假设，该队列中有一部分患者在基线时FEV1正常（≥85%预计值）。具体目标2：确定CF肺病早期结构重塑的敏感性和特异性。研究者的初步研究表明，结构肺重塑的成像标志物可以通过无辐射MRI（而非X射线CT）进行测量。我们通过连续进行超短UTE MRI来评估识别不可逆重塑受试者的敏感性。在第一部分（目标1和2）中，将招募最多50名受试者——大约25名FEV1正常（>85%预计值）和25名轻至中度疾病患者。所有受试者将被要求接受纵向（即大约每年一次）129Xe和UTE MRI、肺功能测定以及肺清除指数（LCI）测量。

如有可能，研究将与临床访视协调进行，以最大限度地提高招募和保留率。还可能招募最多50名年龄和性别匹配的对照受试者（即无已知心肺疾病的受试者），以提供来自健康受试者的参考数据集用于比较。可根据需要招募健康成人（包括CCHMC员工）和5岁以上儿童，用于MRI序列开发和验证。在第二组（目标3）中，将从已接受临床支气管镜检查的患者中招募50名伴有支气管扩张的CF患者和50名非CF支气管扩张患者。在支气管镜检查前，受试者将接受UTE检查。将从影像学正常区域和异常区域获取BAL。注意，在CCHMC，对CF和非CF支气管扩张患者进行多部位图像引导采样是常规做法。因此，

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。