非结核分枝杆菌传播中的前瞻性医疗相关联系研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05686837

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数据说明

条件：囊性纤维化、非结核分枝杆菌肺部感染。这是一项前瞻性、多中心、非随机研究，旨在调查目前参与HALT NTM研究的六个CF照护中心中潜在的NTM暴发。该研究将调查参与研究的美国照护中心内潜在的医疗相关NTM传播和/或获得事件，并结合医疗环境采样和居住地流域分析。A部分/流行病学调查：科罗拉多NTM结局测量推进核心国家资源中心（CO-NRC）为CF NTM提供国家参考实验室。从美国各地CF照护中心收到的NTM呼吸道分离株将进行培养、分子鉴定、抗菌药物敏感性试验和全基因组测序（WGS）。通过这种方法，CO-NRC已识别出NTM分离株聚集，即在基因组水平上高度相似的菌株，由同一CF照护中心接受照护的两名或多名囊性纤维化患者（pwCF）携带。

这些鉴定结果加剧了人们对潜在医疗相关NTM感染的担忧，其来源可能是患者间传播或中心内共同的环境来源。母体HALT NTM研究采用整合的临床和流行病学研究方法，开发并验证了一套医疗相关流行病学调查工具包，可在中心内识别NTM分离株高度相似的患者之间在照护来源上的重叠。母体HALT NTM工具包促进了一个分步流程，使各中心能够对CO-NRC鉴定为感染聚集性NTM分离株的患者进行流行病学评估。这项针对潜在NTM暴发的回顾性母体HALT NTM研究已在六个参与的CF照护中心完成。在pHALT NTM研究中，参与站点将在两年期间前瞻性地将所有接受常规照护的PwCF的所有呼吸道NTM分离株提交至NJH高级诊断实验室。所有NTM均

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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