PRJEB57842：小鼠烫伤模型揭示中性粒细胞及中性粒细胞胞外诱捕网在严重烧伤中的作用

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB57842

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数据说明

引言 严重烧伤会引起独特的病理生理改变，尤其在免疫系统方面。为理解热损伤后免疫反应的基础并开发新的手术或药理学策略，我们对小鼠烫伤模型进行了优化，并分析了生化方面的变化，包括NETs和DNases的作用。方法 本研究纳入30只C57BL/6小鼠，采用4种不同热水暴露时间的烫伤模型。另设一个观察时间更短的烫伤组以降低死亡率并研究病理生理学的极早期阶段。在24小时和72小时分别采血，并分析组织（伤口、肝脏、肺、脾脏）中NETs、氧化应激、细胞凋亡、细菌易位和细胞外基质组织的标志物。此外，对肺和肝组织进行了转录组分析。结果 热水暴露7秒会导致显著的全身和局部效应，但晚期死亡率较高。因此，在该组中，观察时间缩短至24小时。为研究烧伤的后期阶段（72小时），6秒的暴露时间更为有利。

两种条件均导致胶原蛋白显著解聚、氧化应激增加、NET标志物（H3Cit、NE、MPO）升高、细胞凋亡（cC3）以及DNase 1和1l3水平的改变。转录组分析显示，参与急性期信号传导、细胞黏附、细胞外基质组织和免疫应答的基因发生了显著改变。结论：确定了两种不同的烫伤模型条件，分别用于分析烧伤的早期（24小时）或晚期（72小时）效应。两种模型均诱导出可重复且标准化的烫伤损伤。特征分析揭示了中性粒细胞活性和氧化应激的重要参与。转录组分析可用于所涉及通路的机制分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。