瘢痕疙瘩形成过程中的RNA-Seq和miRNA表达数据时序整合分析 [RNA-seq]
该数据集是一个包含RNA-Seq和miRNA表达谱的多模态转录组学数据，来源于瘢痕疙瘩易感个体和健康对照的时序皮肤活检样本，主要用于研究瘢痕疙瘩形成的分子机制，通过整合分析揭示了在伤口愈合过程中差异表达的非编码RNA与基因以及相关的关键信号通路和代谢通路，为理解瘢痕病理生物学和寻找治疗靶点提供了全面的数据资源。
基本信息
资源简介
该数据集是一个针对瘢痕疙瘩（一种常见的过度伤口瘢痕）形成机制的转录组学研究数据集。它包含来自瘢痕疙瘩易感个体（n=8）和健康对照个体（n=6）的系列皮肤活检样本（基线及伤口后六周）的RNA-Seq和miRNA表达谱数据。通过生物信息学分析，该数据集鉴定了在瘢痕易感个体伤口愈合过程中特异性差异表达的37个miRNA和1449个基因，并揭示了NOTCH信号、MAPK信号、Toll样受体通路、DNA修复、p53信号以及多种代谢通路在瘢痕形成过程中的改变。数据来源于对同一部位进行时序采样，并通过整合分析揭示关键的生物学通路。该数据集主要用于瘢痕疙瘩的分子机制研究、伤口愈合生物学探索以及潜在的药物靶点发现。
下载信息
注册下载
Tips: 该数据集需要在对应的数据源网站注册通过后，才能进行数据下载，注册有对应要求，或者需要收费。
暂未开放公开下载
Tips: 该数据集属于公开下载，应该可以免费公开下载。
暂未开放有偿下载
Tips: 该数据集 Qianfanghub 可以协助提供有偿下载服务，注意，服务不针对数据相关产权，只是技术服务费。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=9a8e1a9cad974f3c9e59c462ff7da871
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个针对瘢痕疙瘩（一种常见的过度伤口瘢痕）形成机制的转录组学研究数据集。它包含来自瘢痕疙瘩易感个体（n=8）和健康对照个体（n=6）的系列皮肤活检样本（基线及伤口后六周）的RNA-Seq和miRNA表达谱数据。通过生物信息学分析，该数据集鉴定了在瘢痕易感个体伤口愈合过程中特异性差异表达的37个miRNA和1449个基因，并揭示了NOTCH信号、MAPK信号、Toll样受体通路、DNA修复、p53信号以及多种代谢通路在瘢痕形成过程中的改变。数据来源于对同一部位进行时序采样，并通过整合分析揭示关键的生物学通路。该数据集主要用于瘢痕疙瘩的分子机制研究、伤口愈合生物学探索以及潜在的药物靶点发现。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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