PRJDB16020：乳酸处理的胰腺导管腺癌相关成纤维细胞
胰腺导管腺癌（PDAC）细胞以糖酵解增强而著称，这会导致 PDAC 肿瘤微环境（TME）中乳酸积累。有证据表明，由乳酸介导的 TME 与肿瘤细胞之间的相互作用可促进基质细胞（如癌症相关成纤维细胞（CAFs））的重编程
基本信息
资源简介
PRJDB16020：乳酸处理的胰腺导管腺癌相关成纤维细胞
胰腺导管腺癌（PDAC）细胞以糖酵解增强而著称，这种代谢特征会导致乳酸在PDAC肿瘤微环境（TME）中不断积累。已有证据表明，由乳酸介导的TME与肿瘤细胞之间的相互作用，可以促进基质细胞如癌症相关成纤维细胞（CAFs）的重编程。本数据集聚焦于经乳酸处理的胰腺导管腺癌癌症相关成纤维细胞，通过转录组分析来探索乳酸刺激对CAFs基因表达的影响，属于肿瘤领域的基础研究数据，来源于ebi.ac.uk。
【数据集背景】
胰腺导管腺癌是一种以增强糖酵解为特征的肿瘤，这种代谢方式使得乳酸在肿瘤微环境中积累。肿瘤微环境与肿瘤细胞之间由乳酸介导的相互作用，被认为能够促进基质细胞的重编程，其中癌症相关成纤维细胞是重要的基质细胞类型。为了深入理解乳酸刺激对CAFs的影响，研究者对来源于PDAC患者肿瘤样本的CAFs进行了转录组分析，以探索在乳酸刺激下CAFs中发生改变的基因。该数据集正是围绕这一研究目标而建立。
【数据内容】
本数据集的核心内容是来源于PDAC患者肿瘤样本的CAFs在乳酸刺激条件下的转录组分析结果。研究通过比较乳酸刺激的CAFs与对照CAFs，发现与免疫抑制相关的基因表达显著上调，例如IL6和磷脂酰肌醇聚糖锚定生物合成F类（PIGF）。这些基因表达变化构成了数据集的主要观测内容，反映了乳酸刺激对CAFs转录谱的影响。数据集英文名称为PRJDB16020: Lactate-treated cancer-associated fibroblasts of pancreatic ductal adenocarcinoma，本站分类归入肿瘤/其他。
【采集与来源】
该数据集来源于ebi.ac.uk。研究材料为从PDAC患者肿瘤样本中获得的癌症相关成纤维细胞。实验处理包括乳酸刺激和对照条件，随后进行转录组分析。关于样本的具体数量、患者临床信息、测序平台、测序深度、试剂批次等详细采集信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于探索胰腺导管腺癌肿瘤微环境中乳酸对癌症相关成纤维细胞基因表达影响的研究场景。具体而言，可用于分析与免疫抑制相关的基因如IL6和PIGF在乳酸刺激下的表达变化，也可为理解TME与肿瘤细胞之间由乳酸介导的相互作用提供转录组层面的参考。此外，该数据集可能对研究CAFs重编程、PDAC微环境免疫抑制机制等方向具有应用价值。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以转录组分析结果的形式提供，用户可根据研究目的对乳酸刺激组与对照组的基因表达数据进行比较分析，重点关注IL6和PIGF等免疫抑制相关基因的表达变化。关于数据的具体下载方式、文件格式、数据处理流程、分析工具推荐等操作细节，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于PDAC患者肿瘤样本来源的CAFs进行乳酸刺激实验，并获得了转录组分析结果，发现IL6和PIGF等免疫抑制相关基因显著上调。然而，关于样本量大小、实验重复次数、统计效力、测序质量参数、数据完整性评估等信息，源站未提供。因此，在使用该数据集时，需注意其可能存在的样本代表性、实验条件差异等潜在限制，具体限制内容源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、数据访问权限等信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB16020
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
胰腺导管腺癌（PDAC）细胞以糖酵解增强而著称，这会导致乳酸在PDAC肿瘤微环境（TME）中积累。有证据表明，由乳酸介导的TME与肿瘤细胞之间的相互作用可促进基质细胞（如癌相关成纤维细胞（CAFs））的重编程。我们对来源于一例PDAC患者肿瘤样本的CAFs进行了转录组分析，以探究乳酸刺激后CAFs中发生改变的基因。我们发现，与免疫抑制相关的基因，如IL6和磷脂酰肌醇聚糖锚定生物合成F类（PIGF），在乳酸刺激的CAFs中较对照组显著上调。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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