PRJDB13116：混合极化巨噬细胞来源的IL-1β激活成纤维细胞并协同形成促癌微环境

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB13116

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

弥漫型胃癌（DGC）患者预后不良。然而，DGC细胞与肿瘤微环境（TME）之间相互作用的复杂机制仍不清楚。我们采用一种原创的三维三元共培养系统来研究DGC细胞、成纤维细胞和巨噬细胞之间的多细胞串扰。我们特别鉴定出分泌IL-1b的M1/M2混合型巨噬细胞，其可诱导非癌性成纤维细胞（NFs）转化为癌相关成纤维细胞样（CAF-like）细胞。另一方面，TME中的IL-6与集落刺激因子2（GM-CSF）协同作用，以维持M1/M2混合型巨噬细胞的稳态。我们的研究揭示了TME中的一个正反馈回路，这有助于全面理解TME中巨噬细胞的极化，并有利于DGC治疗方法的改进。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。