PRJDB14837：小鼠骨髓中4T1乳腺癌移植的影响
癌症会对宿主器官和细胞产生不利影响，破坏宿主稳态。然而，癌细胞如何影响远端器官仍未被完全理解。在本研究中，我们利用转录组分析来理解 4T1 乳腺癌细胞（最常用的小鼠癌症模型之一）对骨髓的影响
基本信息
资源简介
PRJDB14837：小鼠骨髓中4T1乳腺癌移植的影响
PRJDB14837 是一个聚焦于肿瘤对远端器官影响的转录组研究数据集，英文全称为“The effects of 4T1 breast cancer transplantation in the bone marrow in mice”，在分类上归属于肿瘤 / 乳腺癌方向，来源站为 ebi.ac.uk。该数据集围绕一个核心问题展开：癌症不仅影响原发部位，还会对宿主器官和细胞产生不利影响，破坏宿主稳态，但癌细胞究竟如何影响远端器官，目前仍未被完全理解。为此，研究采用转录组分析手段，考察常用小鼠癌症模型之一——4T1 乳腺癌细胞——对骨髓的影响。研究对象包括假手术小鼠与携带 4T1 肿瘤的小鼠，取样时间点为移植后 14 天，旨在刻画由 4T1 移植所引起的基因表达变化。整体而言，该数据集为理解乳腺癌远端器官效应，尤其是骨髓层面的分子响应，提供了转录组层面的观察窗口。
【数据集背景】
癌症对宿主的影响并不局限于原发肿瘤部位。源站描述指出，癌症会对宿主器官和细胞产生不利影响，并破坏宿主稳态；然而癌细胞如何影响远端器官，仍未被完全理解。正是在这一背景下，该研究选择 4T1 乳腺癌细胞作为模型。4T1 是最常用的小鼠癌症模型之一，而骨髓作为远端器官/组织，成为本研究关注的对象。研究希望通过转录组分析，理解 4T1 乳腺癌细胞对骨髓的作用，并刻画移植后骨髓中发生的基因表达改变。
【数据内容】
该数据集的核心内容是转录组分析结果，用于比较假手术小鼠与携带 4T1 肿瘤小鼠的骨髓。具体而言，研究分析了来自假手术组和 4T1 荷瘤小鼠的骨髓，取样时间为移植后 14 天，并在此基础上刻画由 4T1 移植导致的基因表达变化。数据集英文名中明确点出主题为“4T1 breast cancer transplantation in the bone marrow in mice”，即小鼠骨髓中 4T1 乳腺癌移植的影响。除上述转录组分析与基因表达变化外，源站未提供更细的数据类型、文件格式或数据规模信息。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk。研究对象为小鼠，涉及假手术组与 4T1 荷瘤组，荷瘤组的取样时间点为移植后 14 天。研究采用转录组分析来获取骨髓中的基因表达信息。关于样本量、测序平台、具体实验流程、伦理审批信息等，源站未提供。
【适用场景】
基于其研究设计，该数据集适用于关注乳腺癌远端器官效应的场景，尤其是 4T1 乳腺癌模型对骨髓影响的转录组研究。它可用于理解癌症如何破坏宿主稳态、癌细胞如何影响远端器官这一更广泛的问题，也可作为 4T1 小鼠癌症模型相关转录组分析的参考。由于数据涉及假手术与 4T1 荷瘤小鼠在移植后 14 天的骨髓比较，适合用于考察该时间点下由 4T1 移植引起的基因表达变化。其他具体应用方向，源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、分析流程、预处理步骤或推荐工具等。使用者如需使用，应参考来源站 ebi.ac.uk 上该数据集对应的说明。源站未提供。
【质量与限制】
该研究基于转录组分析，对假手术与 4T1 荷瘤小鼠的骨髓进行比较，取样时间为移植后 14 天。其局限性与质量控制相关信息，源站未提供。需要注意，该数据集仅针对 4T1 乳腺癌细胞这一常用小鼠模型，且取样时间点固定为移植后 14 天，相关结论的适用范围应以源站描述为准。其他质量指标与限制条件，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk，英文名为“PRJDB14837: The effects of 4T1 breast cancer transplantation in the bone marrow in mice”。关于引用方式、许可条款或使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB14837
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
癌症会对宿主器官和细胞产生不良影响，破坏宿主稳态。然而，癌细胞如何影响远处器官仍未被完全了解。在本研究中，我们利用转录组分析来了解4T1乳腺癌细胞——最常用的小鼠癌症模型之一——如何影响骨髓。我们分析了假手术组和4T1荷瘤小鼠（移植后14天）的骨髓，并刻画了由4T1移植引起的基因表达变化。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
