整合多组学分析揭示PDCoV感染仔猪中PPAR信号网络与代谢免疫失调及肠道损伤的关联

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS14236

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数据说明

猪δ冠状病毒（PDCoV）是一种新发肠道冠状病毒，可导致新生仔猪严重腹泻和高死亡率，并已证实具备感染人类细胞的能力。然而，决定疾病结局的宿主应答网络仍知之甚少。在此，我们对PDCoV感染仔猪的空肠组织进行了转录组学、蛋白质组学和代谢组学的整合分析，这是该病原体主要靶器官中的首次此类分析。多组学整合鉴定出一个核心宿主应答网络，其特征为强效I型干扰素介导的抗病毒应答与脂质代谢显著改变的同步激活。过氧化物酶体增殖物激活受体（PPAR）信号通路是富集最显著的通路之一，表现为LPL、FABP3和SCD的协同上调以及SLC27A2的下调。代谢组学分析表明膜甘油磷脂的广泛降解以及花生四烯酸-前列腺素炎症轴的改变，其证据为底物消耗和促炎介质20-羟基-PGE2的积累。

我们提出一个假设性工作模型，其中PDCoV感染与PPAR网络调节相关，可能促进脂质资源重分配以及促炎微环境的建立，从而可能加剧肠道损伤。值得注意的是，在这些PDCoV相关改变与严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）感染中报道的代谢-免疫失调之间可观察到相似性，这提出了冠状病毒间存在共同致病特征的假设。我们的发现突显了PPAR通路及其下游脂质介质作为值得进一步研究的潜在治疗靶点，并提示现有PPAR激动剂可能值得在未来的研究中作为候选药物进行重定位评估。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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