感染期间炎症性ILC2s利用阶段特异性S1P受体迁移至远端组织

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Af622963c041bf0574c192ac01cc5804895a619d9443cc3c0de3ffe99aed1f1f8

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

组织驻留淋巴细胞能够再循环，但其潜在的分子机制尚不清楚。在此，我们表明蠕虫感染诱导的2型固有淋巴细胞（ILC2s）重新分布需要进入淋巴管。白细胞介素（IL）-25信号诱导肠道ILC2s的表观遗传景观发生显著变化，转录因子KLF2和ZEB2分别上调1-磷酸鞘氨醇受体1（S1PR1）和S1PR5的表达。S1PR5调控ILC2从肠道进入淋巴液，而S1PR1对ILC2从肠系膜淋巴结进入血液，进而进入包括肺在内的远端组织至关重要，重新分布的ILC2s在肺中参与组织修复。需要两种S1PR很大程度上是由于CD69的动态表达，CD69介导S1PR1的内化。

这些发现表明，S1PRs以阶段特异性方式调节ILC2从非淋巴器官和淋巴器官的迁出，为……提供了一个框架，# 炎性ILC2在感染期间利用阶段特异性S1P受体迁移至远端组织 数据集DOI：10.5061/dryad.76hdr7t8z ## 数据和文件结构说明 ### 文件和变量 #### 文件：GSE268826_genomon_fpkm_table.csv.gz 描述： 对未处理小鼠的稳态肠道驻留ILC2s（gILC2s）以及经白细胞介素-25（IL-25）处理小鼠的肠道、肠系膜淋巴结（mLNs）和肺部的炎性ILC2s（iILC2s）进行批量RNA测序（RNA-seq）获得的每千碱基百万片段数（FPKM）数据。 #### 文件：GSE270373_Gut_ILC2_merged.bw 描述： 对gILC2s和IL-25诱导的mLN iILC2s进行转座酶可及染色质测序（ATAC-seq）获得的Bigwig（.bw）文件。 #### 文件：GSE270373_iILC2_merged.bw 描述： 对gILC2s和IL-25诱导的mLN iILC2s进行ATAC-seq获得的.bw文件。 #### 文件：ATAC_Resident_gILC2_merged.bw 描述： .bw文

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。