NH4Cl处理猪肺泡巨噬细胞3D4/21的RNA-seq表达谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE350518

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

氨（NH₃）是集约化养猪生产系统中普遍存在的空气污染物，其浓度升高与猪呼吸道疾病和胸膜肺炎病变的增加相关。肺巨噬细胞是呼吸道防御的核心，其极化状态关键性地决定了遭遇病原体后的结局。M2极化巨噬细胞是猪呼吸道疾病病变的标志性特征，但NH₃暴露是否驱动这种极化仍不清楚。在此，我们证明30天暴露于50 ppm NH₃可在体内诱导猪肺巨噬细胞的M2极化。利用猪肺泡巨噬细胞（3D4/21），我们表明NH₄Cl以浓度和时间依赖的方式上调M2标志物ARG1和转录因子NR4A1。在机制上，NH₄Cl触发胆固醇积累，后者通过NR4A1结合ARG1启动子促进ARG1表达。这一胆固醇-NR4A1-ARG1轴代表了一条此前未被认识的通路，将环境NH₃暴露与巨噬细胞极化联系起来，并为未来旨在减轻养猪生产中NH₃相关肺病理的研究提供了一个机制明确的靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。