猪背根神经节神经元snRNAseq分子特征数据集
该数据集提供猪背根神经节(DRG)的单核RNA测序(snRNAseq)数据,聚焦于睡眠痛觉感受器的分子标志物。数据结合高通量测序与详细的组织处理流程,有助于深入理解痛觉感受器的多样性,并为感觉与疼痛研究提供参考
![GSE263320: snRNAseq molecular characterization of pig dorsal root ganglion neurons [snRNAseq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/105063.jpg)
基本信息
资源简介
猪背根神经节神经元snRNAseq分子特征数据集
该数据集为猪背根神经节(DRG)神经元的单核RNA测序(snRNAseq)分子特征数据,英文名称为 GSE263320: snRNAseq molecular characterization of pig dorsal root ganglion neurons [snRNAseq],源站标题与英文名称一致。数据聚焦于睡眠痛觉感受器的分子标志物,将高通量测序与详细的组织处理流程相结合,旨在推进对痛觉感受器多样性的认识,并为感觉与疼痛研究提供参考。数据集归属于神经系统疾病 / 其他分类,来源于 ncbi.nlm.nih.gov,共包含 1 个文件,样例文件为 GSE263320_series_matrix.txt.gz。作者为 Hans 与 Jürgen Solinski,发布时间为 Apr 05 202。整体而言,该数据集面向痛觉与感觉神经生物学研究,提供猪 DRG 层面的单核转录组分子刻画资源。
【数据集背景】
背根神经节(DRG)是感觉神经元的聚集部位,在痛觉与感觉信号传导中具有重要作用。该数据集以猪为研究对象,针对睡眠痛觉感受器(sleeping nociceptors)的分子标志物开展单核RNA测序分析,试图从分子层面刻画 DRG 神经元的组成与特征。源站描述指出,该数据集将高通量测序与详细的组织处理流程相结合,有助于加深对痛觉感受器多样性的理解,并为感觉与疼痛研究提供参考。数据集在源站被归入神经系统疾病 / 其他分类,主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL29175 与 9823,提示其属于高通量测序表达谱类数据,并涉及相应的平台与物种标识信息。
【数据内容】
该数据集提供猪背根神经节(DRG)的单核RNA测序数据,核心关注点为睡眠痛觉感受器的分子标志物。数据以高通量测序方式获取,属于表达谱分析范畴。数据集共包含 1 个文件,样例文件名为 GSE263320_series_matrix.txt.gz,从文件名看为系列矩阵文件,并采用 GZIP 压缩格式。源站描述强调,该数据结合了详细的组织处理流程,说明其数据产出与样本组织处理环节密切相关。除上述信息外,关于样本数量、测序深度、细胞核数量、基因覆盖情况等具体指标,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,作者为 Hans 与 Jürgen Solinski,发布时间为 Apr 05 202。研究对象为猪的背根神经节,数据获取方式为单核RNA测序,属于高通量测序表达谱类型。主题标签中包含 GPL29175 与 9823,分别对应平台与物种相关的标识信息。关于具体的组织采集流程、动物来源、伦理审批信息、测序平台详细参数等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于感觉与疼痛研究相关方向,尤其是围绕痛觉感受器多样性、睡眠痛觉感受器分子标志物以及猪 DRG 神经元分子特征的分析工作。由于其为单核RNA测序表达谱数据,可用于探索 DRG 中不同神经元群体的分子特征。源站描述指出,该数据可为感觉与疼痛研究提供参考。关于更具体的适用分析类型(如差异表达分析、细胞类型注释、聚类分析等),源站未提供明确说明。
【使用方法】
使用该数据集时,可先下载数据文件 GSE263320_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包,需按对应格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因格式或编码问题导致后续分析出错。关于读取所需的具体软件、脚本或参数设置,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集共包含 1 个文件,样例文件为 GSE263320_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。关于数据质量评估指标、批次效应、测序质量、细胞核捕获效率、是否存在缺失值或噪声等具体质量信息,源站未提供。关于该数据集在物种覆盖、样本代表性或分析结论上的限制,源站亦未提供。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Hans 与 Jürgen Solinski,发布时间为 Apr 05 202。关于具体的引用格式、文献出处、许可协议或使用条款,源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE263320
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集提供了来自猪背根神经节(DRG)的snRNAseq数据,旨在研究睡眠状态伤害感受器的分子标志物。它结合了高通量测序与精细的组织处理技术,增进了我们对伤害感受器多样性的认识,并为感觉与疼痛研究提供了见解。
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![猪背根神经节神经元空间转录组分子特征 [Visium]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/105057.jpg)


