猪链球菌Stk1致呼吸道上皮细胞铁死亡与屏障破坏数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE311550

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

猪链球菌血清型2型（SS2）是一种重要的人畜共患病原体，通过突破呼吸道上皮屏障引发全身性感染。铁死亡是一种由脂质过氧化驱动的铁依赖性调节性细胞死亡形式，日益被认为与多种感染性疾病的发病机制相关，但其在SS2诱导的上皮屏障功能障碍中的作用仍不清楚。在此，我们证明SS2感染使气道上皮细胞对铁死亡敏感，导致脂质过氧化物积累、转录抑制因子Snail1上调以及随后的细胞间连接蛋白下调。这一级联反应破坏上皮完整性并促进细菌易位。在机制上，我们发现SS2压倒了细胞氧化还原防御系统，并鉴定出细菌真核样丝氨酸/苏氨酸激酶1（Stk1）是该过程的关键介导因子。Stk1直接与宿主蛋白Keap1相互作用，从而稳定Keap1-Nrf2复合物。

这种稳定作用增强了Nrf2的泛素化及其随后的蛋白酶体降解，而Nrf2是抗氧化反应的主要调节因子，从而削弱了细胞中和脂质过氧化物的能力。总之，本研究揭示了一种新的毒力机制，其中SS2效应蛋白Stk1促进Nrf2降解以触发铁死亡，最终导致呼吸道上皮屏障的破坏。这些发现表明，抑制铁死亡可能代表一种有前景的治疗策略，用于SS2感染的临床预防和治疗。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。