GNPS 气相色谱低分辨三重四极杆 WinCF 研究数据 SPME
该数据集为来自 omicsdi.org 的 GC-MS 数据,属于呼吸系统疾病/其他类别,主题标签为 Metabolomics

基本信息
资源简介
GNPS 气相色谱低分辨三重四极杆 WinCF 研究数据 SPME
GNPS_GC_Low res QqQ WinCF study data_SPME 是一个以气相色谱-质谱(GC-MS)为核心技术手段的代谢组学数据集,来源于 omicsdi.org,在分类上归入呼吸系统疾病/其他类别,主题标签为 Metabolomics。该数据集与囊性纤维化肺部研究相关,围绕痰液样本中挥发性有机化合物(VOC)的纵向观测展开,采用固相微萃取(SPME)对痰液样本上方的挥发物进行采样后再行 GC-MS 分析。从命名中的低分辨三重四极杆(Low res QqQ)信息看,其质谱采集依托三重四极杆平台完成。整体而言,该数据集面向呼吸系统疾病相关的微生物组与代谢物交叉研究,为探索痰液挥发性代谢物与肺部病理过程之间的关联提供了可复用的原始数据资源。
【数据集背景】
该数据集所依托的研究关注囊性纤维化肺部的嗜中性粒细胞蛋白水解过程与致病性微生物组之间的相关性。源站描述中给出的研究标题为“Neutrophilic proteolysis in the cystic fibrosis lung correlates with a pathogenic microbiome”,作者包括 RA Quinn、S Adem、RH Mills、W Comstock、LDR Goldasich、G Humphrey 等,成果发表于 Microbiome 第 7 卷第 1 期,文章编号 23。研究以痰液为样本介质,通过纵向采样追踪挥发性有机化合物的变化,从而在代谢层面刻画肺部微生物活动与宿主炎症/蛋白水解过程之间的联系。数据集即产生于这一研究背景之下。
【数据内容】
数据内容为 GC-MS 数据,具体是痰液样本挥发性有机化合物(VOC)的纵向观测数据。样本前处理采用固相微萃取(SPME),对痰液样本上方的顶空挥发物进行富集后进样分析。数据在主题上归属代谢组学(Metabolomics),在站点分类中归入呼吸系统疾病/其他。关于具体样本数量、化合物鉴定数目、纵向时间点数量以及数据文件格式等信息,源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 omicsdi.org。采集对象为痰液样本上方空间的挥发性组分,采集方式为 SPME 顶空采样,检测手段为 GC-MS;数据集名称中的“Low res QqQ”提示质谱部分使用低分辨三重四极杆仪器。研究队列、采样地点、采样时间跨度与伦理审批等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病特别是囊性纤维化相关的代谢组学与微生物组交叉研究,可用于痰液挥发性有机化合物谱的比较分析、纵向变化趋势探索,以及挥发性代谢物与致病性微生物组、嗜中性粒细胞蛋白水解等宿主过程之间关联的验证性研究。也可作为 GC-MS 挥发性代谢组数据处理流程与分析方法开发、方法学比较的测试数据。其他具体应用方向源站未提供。
【使用方法】
使用时可结合 SPME 顶空采样与 GC-MS 分析的技术特点,对挥发性化合物谱进行预处理、峰提取与统计分析,并与同一研究中的微生物组及蛋白水解相关结果进行整合解读。关于数据下载方式、文件组织说明、预处理参数与推荐分析工具,源站未提供。
【质量与限制】
数据集基于低分辨三重四极杆质谱采集,其质量精度与高分辨质谱相比存在固有差异,化合物鉴定的确定性可能受此影响;同时 SPME 顶空采样结果受采样条件影响较大。关于数据完整性、缺失值情况、批次效应与质控样本设置等具体质量信息,源站未提供。
【引用与许可】
引用时应参照源站描述中给出的研究成果:RA Quinn、S Adem、RH Mills、W Comstock、LDR Goldasich、G Humphrey 等发表于 Microbiome 第 7 卷第 1 期、文章编号 23 的论文。数据的具体许可协议与使用条款,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/gnps/MSV000084348
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
来自以下研究的GC-MS数据:来自以下研究的纵向痰液VOC数据:囊性纤维化肺中性粒细胞蛋白水解与致病性微生物组相关 RA Quinn, S Adem, RH Mills, W Comstock, LDR Goldasich, G Humphrey, … RA Quinn, S Adem, RH Mills, W Comstock, LDR Goldasich, G Humphrey, … Microbiome 7 (1), 23 痰液样本上方的挥发性物质采用SPME进行采样。
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