GNPS-Burkholderia_trimethoprim_SCFM2vsLB数据集

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/gnps/MSV000087793

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

新洋葱伯克霍尔德菌（Burkholderia cenocepacia）感染可导致免疫功能低下个体出现危及生命的疾病，包括囊性纤维化（CF）患者。尽管已有报道指出不同新洋葱伯克霍尔德菌菌株存在遗传变异，但CF肺部环境条件如何影响可能影响这些菌株毒力的的小分子产生仍不清楚。本研究比较了三株临床新洋葱伯克霍尔德菌菌株在合成CF痰培养基（SCFM2）和常规实验室培养基（LB）中培养、在有无抗生素甲氧苄啶存在条件下的代谢组学特征。采用基于质谱的非靶向代谢组学方法，我们鉴定出在SCFM2与LB培养基中差异产生的若干化合物类别，包括铁载体、抗菌物质、群体感应信号及多种脂质家族。此外，我们描述了抗生素甲氧苄啶诱导的代谢组学变化在SCFM2与LB中的差异。本研究所描述的差异为理解新洋葱伯克霍尔德菌产生的次级代谢产物多样性提供了见解。

在代表CF相关肺部环境中营养条件的条件下，新洋葱伯克霍尔德菌菌株。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。