全光谱荧光寿命成像数据集(0.5 nm光谱与50 ps时间分辨率)

本数据集包含全光谱荧光寿命成像(FS-FLIM)论文图2至图5的数据,涉及0.5 nm光谱和50 ps时间分辨率。Code_Full_Spectral_FLIM包含FS-FLIM数据立方体分析代码及自定义感兴趣区域提取代码,需Matlab 2019a或更高版本运行

datashare_ed
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图像回归FluoresenceFluorescence lifetimeOptical imagingMicroscopySpectral Imaginghyperspectralmultispectral
Data for publication "Full spectral fluorescence lifetime Imaging with 0.5 nm spectral and 50 ps temporal resolution"

基本信息

模态
图像
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

全光谱荧光寿命成像数据集(0.5 nm光谱与50 ps时间分辨率)

本数据集包含全光谱荧光寿命成像(FS-FLIM)论文图2至图5的数据,涉及0.5 nm光谱和50 ps时间分辨率。Convallaria_Data对应图2,BeeWing_Data对应图3,均为FS-FLIM数据立方体;Lung_Tissue_Slide_Stained_Data和Lung_Tissue_Slide_Unstained_Data对应图4,各含60个数据立方体;Fresh_Lung_Tissue_Data对应图5,含20个数据立方体,上述文件夹名对应成像系统样品台位置。Code_Full_Spectral_FLIM包含FS-FLIM数据立方体分析代码及自定义感兴趣区域提取代码,需Matlab 2019a或更高版本运行。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本数据集包含论文“具有0.5 nm光谱分辨率和50 ps时间分辨率的全光谱荧光寿命成像”中图2至图5所依据的数据。数据文件包含如下全光谱荧光寿命成像(FS-FLIM)数据:Convallaria_Data包含图2的数据,该数据由一个FS-FLIM数据立方体组成,可使用文件“Code_Full_Specral_FLIM”中的代码进行分析,该代码需要Matlab(2019a或更高版本)才能运行。BeeWing_Data以FS-FLIM数据立方体的形式包含与图3对应的数据。Lung_Tissue_Slide_Stained_Data和Lung_Tissue_Slide_Unstained_Data包含图4的数据,二者各包含60个已格式化以便分析的FS-FLIM数据立方体,文件夹名称对应成像系统样品台上的位置。Fresh_Lung_Tissue_Data以20个FS-FLIM数据立方体的形式包含图5的数据,文件夹名称对应成像系统样品台上的位置。Code_Full_Spectral_FLIM集包含用于FS-FLIM数据立方体主要分析的代码,以及用于从分析后数据中提取自定义感兴趣区域的更多代码。各文件夹包含关于如何使用代码的“readme”文件,代码本身也包含大量注释。

【主题与分类】

主题标签:Fluoresence、Fluorescence lifetime、Optical imaging、Microscopy、Spectral Imaging、hyperspectral、multispectral。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/3973

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源站:https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/3973

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集包含论文“具有0.5 nm光谱分辨率和50 ps时间分辨率的全光谱荧光寿命成像”中图2至图5所依据的数据。数据文件包含如下全光谱荧光寿命成像(FS-FLIM)数据:Convallaria_Data包含图2的数据,该数据由一个FS-FLIM数据立方体组成,可使用文件“Code_Full_Specral_FLIM”中的代码进行分析,该代码需要Matlab(2019a或更高版本)才能运行。BeeWing_Data以FS-FLIM数据立方体的形式包含与图3对应的数据。Lung_Tissue_Slide_Stained_Data和Lung_Tissue_Slide_Unstained_Data包含图4的数据,二者各包含60个已格式化以便分析的FS-FLIM数据立方体,文件夹名称对应成像系统样品台上的位置。Fresh_Lung_Tissue_Data以20个FS-FLIM数据立方体的形式包含图5的数据,文件夹名称对应成像系统样品台上的位置。Code_Full_Spectral_FLIM集包含用于FS-FLIM数据立方体主要分析的代码,以及用于从分析后数据中提取自定义感兴趣区域的更多代码。各文件夹包含关于如何使用代码的“readme”文件,代码本身也包含大量注释。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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