全光谱荧光寿命成像数据集(0.5 nm光谱与50 ps时间分辨率)
本数据集包含全光谱荧光寿命成像(FS-FLIM)论文图2至图5的数据,涉及0.5 nm光谱和50 ps时间分辨率。Code_Full_Spectral_FLIM包含FS-FLIM数据立方体分析代码及自定义感兴趣区域提取代码,需Matlab 2019a或更高版本运行

基本信息
资源简介
全光谱荧光寿命成像数据集(0.5 nm光谱与50 ps时间分辨率)
本数据集包含全光谱荧光寿命成像(FS-FLIM)论文图2至图5的数据,涉及0.5 nm光谱和50 ps时间分辨率。Convallaria_Data对应图2,BeeWing_Data对应图3,均为FS-FLIM数据立方体;Lung_Tissue_Slide_Stained_Data和Lung_Tissue_Slide_Unstained_Data对应图4,各含60个数据立方体;Fresh_Lung_Tissue_Data对应图5,含20个数据立方体,上述文件夹名对应成像系统样品台位置。Code_Full_Spectral_FLIM包含FS-FLIM数据立方体分析代码及自定义感兴趣区域提取代码,需Matlab 2019a或更高版本运行。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本数据集包含论文“具有0.5 nm光谱分辨率和50 ps时间分辨率的全光谱荧光寿命成像”中图2至图5所依据的数据。数据文件包含如下全光谱荧光寿命成像(FS-FLIM)数据:Convallaria_Data包含图2的数据,该数据由一个FS-FLIM数据立方体组成,可使用文件“Code_Full_Specral_FLIM”中的代码进行分析,该代码需要Matlab(2019a或更高版本)才能运行。BeeWing_Data以FS-FLIM数据立方体的形式包含与图3对应的数据。Lung_Tissue_Slide_Stained_Data和Lung_Tissue_Slide_Unstained_Data包含图4的数据,二者各包含60个已格式化以便分析的FS-FLIM数据立方体,文件夹名称对应成像系统样品台上的位置。Fresh_Lung_Tissue_Data以20个FS-FLIM数据立方体的形式包含图5的数据,文件夹名称对应成像系统样品台上的位置。Code_Full_Spectral_FLIM集包含用于FS-FLIM数据立方体主要分析的代码,以及用于从分析后数据中提取自定义感兴趣区域的更多代码。各文件夹包含关于如何使用代码的“readme”文件,代码本身也包含大量注释。
【主题与分类】
主题标签:Fluoresence、Fluorescence lifetime、Optical imaging、Microscopy、Spectral Imaging、hyperspectral、multispectral。本站分类:呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/3973
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/3973
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本数据集包含论文“具有0.5 nm光谱分辨率和50 ps时间分辨率的全光谱荧光寿命成像”中图2至图5所依据的数据。数据文件包含如下全光谱荧光寿命成像(FS-FLIM)数据:Convallaria_Data包含图2的数据,该数据由一个FS-FLIM数据立方体组成,可使用文件“Code_Full_Specral_FLIM”中的代码进行分析,该代码需要Matlab(2019a或更高版本)才能运行。BeeWing_Data以FS-FLIM数据立方体的形式包含与图3对应的数据。Lung_Tissue_Slide_Stained_Data和Lung_Tissue_Slide_Unstained_Data包含图4的数据,二者各包含60个已格式化以便分析的FS-FLIM数据立方体,文件夹名称对应成像系统样品台上的位置。Fresh_Lung_Tissue_Data以20个FS-FLIM数据立方体的形式包含图5的数据,文件夹名称对应成像系统样品台上的位置。Code_Full_Spectral_FLIM集包含用于FS-FLIM数据立方体主要分析的代码,以及用于从分析后数据中提取自定义感兴趣区域的更多代码。各文件夹包含关于如何使用代码的“readme”文件,代码本身也包含大量注释。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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