数据:胞葬作用与白细胞挤出决定早期分枝杆菌致病进程
本数据集来自 Dryad,对应一项以斑马鱼幼鱼尾鳍局部海分枝杆菌感染为结核病模型的研究,结合共聚焦激光扫描与电子显微镜观察

基本信息
资源简介
数据:胞葬作用与白细胞挤出决定早期分枝杆菌致病进程
Data from: Efferocytosis and extrusion of leukocytes determine the progression of early mycobacterial pathogenesis
本数据集来自 Dryad,对应一项以斑马鱼幼鱼尾鳍局部海分枝杆菌感染为结核病模型的研究,结合共聚焦激光扫描与电子显微镜观察。数据覆盖中性粒细胞与巨噬细胞在感染早期的动态行为,包括中性粒细胞对分枝杆菌的吞噬及其在播散中的作用,以及巨噬细胞对含菌死亡细胞的胞葬作用,并涉及含大菌团吞噬细胞经细胞死亡后被挤出组织的过程。可用于研究白细胞互作、分枝杆菌感染早期致病机制及宿主防御相关图像分析(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2016。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):巨噬细胞和中性粒细胞是抵御入侵病原体的第一响应者,在宿主防御胞内病原体方面发挥重要作用。这些白细胞之间的整体相互作用和动态互作在很大程度上尚不清楚。在本研究中,我们结合共聚焦激光扫描显微镜和电子显微镜,在结核病斑马鱼模型中研究了它们的作用,该模型为幼虫尾鳍组织中的局部海分枝杆菌感染。我们的结果表明,中性粒细胞能有效吞噬分枝杆菌,并在其播散中起重要作用。巨噬细胞似乎在胞葬作用中发挥主要作用,即吞噬含有细菌内容的死亡细胞。形成带有大细菌聚集体的吞噬细胞,这些细胞可在细胞死亡后被挤出组织。或者,这些 e
【主题与分类】
主题标签:Mycobacterium、Leukocyte dynamics、Microscopy、Efferocytosis、Extrusion。本站分类:呼吸系统疾病/肺结核。
【获取与许可】
源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.08803
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
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源站:https://doi.org/10.5061/dryad.08803
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 92.3 MB。
数据说明
巨噬细胞和中性粒细胞是抵御入侵病原体的第一响应者,在宿主防御胞内病原体方面发挥着重要作用。这些白细胞之间的协同作用和动态相互作用在很大程度上尚不清楚。在本研究中,我们结合共聚焦激光扫描显微镜和电子显微镜,在斑马鱼结核病模型中研究了它们的作用,该模型是在幼鱼尾鳍组织中进行局部海分枝杆菌感染。我们的结果表明,中性粒细胞能有效吞噬分枝杆菌,并在其播散中起重要作用。巨噬细胞似乎在胞葬作用——即吞噬含有细菌内容的死亡细胞——中发挥主要作用。形成含有大细菌聚集体的吞噬细胞,这些细胞可在细胞死亡后被排出组织。或者,这些过度感染的细胞可发生坏死,导致周围白细胞立即被招募,随后吞噬释放的细菌。我们的数据显示,这些坏死破裂事件导致感染进展,而排出则减轻感染。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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