小鼠肠道疟疾
本数据集含图像文件,支持关于Plasmodium chabaudi AS感染小鼠肠道炎症与肠道通透性增加的手稿。原始图像为小肠组织全切片40x图,经IHC染GFP靶向疟原虫,或经H&E染色(来源 datashare.ed.ac.uk)

基本信息
资源简介
小鼠肠道疟疾
本数据集含图像文件,支持关于Plasmodium chabaudi AS感染小鼠肠道炎症与肠道通透性增加的手稿。分析这些原始文件的相关文件已存入Open Science Framework(DOI 10.17605/OSF.IO/CVXDY)。原始图像为小肠组织全切片40x图,经IHC染GFP靶向疟原虫,或经H&E染色(来源 datashare.ed.ac.uk)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本数据集提供的图像文件是手稿《感染 Plasmodium chabaudi AS 的小鼠中的肠道炎症和肠道通透性增加》的基础。其他相关文件已存入 'Open Science Framework'(项目标识符:DOI 10.17605/OSF.IO/CVXDY),这些文件用于分析此处提供的原始文件。此处提供的这些原始图像文件是完整小肠组织切片的 40x 图像,这些切片通过 IHC 对 GFP 染色(以靶向疟原虫),或通过 H & E 对肠道组织染色。
【主题与分类】
主题标签:Malaria、Plasmodium、Plasmodium chabaudi、Histology、Intestine、Microscopy。本站分类:感染/寄生虫病。
【获取与许可】
源站页面:https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/4403
下载信息
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源站:https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/4403
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本数据集提供的图像文件是手稿《感染 Plasmodium chabaudi AS 的小鼠中的肠道炎症和肠道通透性增加》的基础。其他相关文件已存入 ‘Open Science Framework’(项目标识符:DOI 10.17605/OSF.IO/CVXDY),这些文件用于分析此处提供的原始文件。此处提供的这些原始图像文件是完整小肠组织切片的 40x 图像,这些切片通过 IHC 对 GFP 染色(以靶向疟原虫),或通过 H & E 对肠道组织染色。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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