晚期基因治疗限制视网膜色素变性小鼠模型视网膜功能恢复
该数据集是一个包含视网膜色素变性小鼠模型基因治疗研究的原始显微图像数据集,数据模态为医学影像,主要用于分析在不同视杆细胞损失阶段(早期、中期、晚期)进行基因治疗干预后,视网膜神经节细胞的敏感性和信号保真度等功能的恢复情况,以评估治疗时间窗对疗效的影响,服务于视网膜疾病机制和基因治疗策略的研究。

基本信息
资源简介
晚期基因治疗限制视网膜色素变性小鼠模型视网膜功能恢复
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Late gene therapy limits the restoration of retinal function in a mouse model of retinitis pigmentosa》。
【数据内容】
源站原始描述:Retinitis pigmentosa is an inherited photoreceptor degeneration that begins with rod loss followed by cone loss. This cell loss greatly diminishes vision, with most patients becoming legally blind. Gene therapies are being developed, but it is unknown how retinal function depends on the time of intervention. To uncover this dependence, we utilize a mouse model of retinitis pigmentosa capable of artificial genetic rescue. This model enables a benchmark of best-case gene therapy by removing variab…
【主题与分类】
主题标签:Microscopy、Retinitis pigmentosa、Confocal microscopy、Retina、Retinal degeneration。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256:08a2cc1ea30bea96bf6dd815ef49b334b780e45eb5d16b3572d30d5d1fc944c5
下载信息
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使用方式
数据集获取
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个用于研究视网膜色素变性(一种遗传性光感受器退行性疾病)基因治疗干预时机的医学影像数据集。数据集包含用于生成研究图表(Figure 1-3)的原始、未处理的显微图像,这些图像来源于一个能够进行人工基因挽救的视网膜色素变性小鼠模型。该研究通过在小鼠模型发生25%(早期)、50%(中期)和70%(晚期)视杆细胞损失时进行完全基因挽救,评估不同干预时间点对视网膜功能(特别是视网膜神经节细胞的敏感性和信号保真度)恢复的影响。数据集主要应用于基因治疗疗效评估、视网膜疾病机制研究和神经科学领域,为理解治疗时间窗对功能恢复的重要性提供了关键的影像学数据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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