共聚焦显微镜胰腺导管分割数据集
该数据集是一个用于胰腺导管分割的共聚焦显微镜图像数据集，包含多组四维（空间三维加时间）灰度图像堆栈以及从原始图像中提取的标注图像块，数据模态为显微镜图像与二进制掩码标注，主要应用于胰腺导管结构的分割研究、发育生物学分析和医学图像处理算法的开发。
基本信息
资源简介
共聚焦显微镜胰腺导管分割数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Confocal Microscopy Pancreatic Ducts Segmentation Dataset》。配套论文《Quantifying Topology In Pancreatic Tubular Networks From Live Imaging 3D Microscopy》发表于 Machine Learning for Biomedical Imaging（2022），DOI：10.59275/j.melba.2022-4bf2。项目资助方：Novo Nordisk Foundation project grant NNF17OC0028360。源站首次发布：2025-11-04。
【数据内容】
源站原始描述：This repository contains a dataset of several raw pancreas confocal microscopy four-dimensional (x, y, z, time) grey-scale image-stacks, each of them taken from an embryonic organ developing ex vivo over time. Each field of view contains only a part of one pancreas, and some images are therefore acquired from the same biological sample. The recorded signal corresponds to the tubular structure of the developing pancreatic duct. The apical domain of ductal cells was visualized by the red fluoresce…
【数据结构与技术规格】
文件数 4 个，合计 687.54 GB。conversion_code.zip：application/zip，12.08 KB。数据集 DOI：10.11583/DTU.29950077.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Biological network analysis。主题标签：Pancreas、Confocal microscopy、Ducts、Tubules、Segmentation。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biological network analysis。
【获取与许可】
源站页面：https://data.dtu.dk/articles/dataset/Confocal_Microscopy_Pancreatic_Ducts_Segmentation_Dataset/29950077
使用许可：Various licenses（https://www.bibliotek.dtu.dk/en/RDMvariouslicenses）。
规范引用：Krivokapic, Jelena Miskovik; Arnavaz, Kasra; Delgado Rodríguez, Pablo; Heilmann, Silja; Kontogianni, Theodora; Semb, Henrik; et al. (2025). Confocal Microscopy Pancreatic Ducts Segmentation Dataset. Technical University of Denmark. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2025-11-05，引用时请注意版本时效。
下载信息
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暂未开放公开下载
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集包含多个原始胰腺共聚焦显微镜四维（x, y, z, 时间）灰度图像堆栈，每个图像均采集自体外发育的胚胎器官。每个视野仅包含胰腺的一部分，部分图像来自同一生物样本。记录的信号对应发育中胰腺导管的管状结构，导管细胞顶端区域通过红色荧光蛋白mCherry（与MUCIN1蛋白基因融合）进行可视化。原始图像以2D切片形式提供以便处理。数据集还包括从原始图像中提取的较小图像块及其对应的胰腺导管二进制人工标注。这些初始的3D图像块同样以2D切片（图像和掩码）形式提供。此外，提供简单的Python脚本用于在2D排列与原始3D版本之间转换。数据适用于胰腺导管分割、共聚焦显微镜图像分析、发育生物学及医学图像处理研究。
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