共聚焦显微镜胰腺导管分割数据集
该数据集是一个用于胰腺导管分割的共聚焦显微镜图像数据集,包含多组四维(空间三维加时间)灰度图像堆栈以及从原始图像中提取的标注图像块,数据模态为显微镜图像与二进制掩码标注,主要应用于胰腺导管结构的分割研究、发育生物学分析和医学图像处理算法的开发。
基本信息
资源简介
该数据集包含多个原始胰腺共聚焦显微镜四维(x, y, z, 时间)灰度图像堆栈,每个图像均采集自体外发育的胚胎器官。每个视野仅包含胰腺的一部分,部分图像来自同一生物样本。记录的信号对应发育中胰腺导管的管状结构,导管细胞顶端区域通过红色荧光蛋白mCherry(与MUCIN1蛋白基因融合)进行可视化。原始图像以2D切片形式提供以便处理。数据集还包括从原始图像中提取的较小图像块及其对应的胰腺导管二进制人工标注。这些初始的3D图像块同样以2D切片(图像和掩码)形式提供。此外,提供简单的Python脚本用于在2D排列与原始3D版本之间转换。数据适用于胰腺导管分割、共聚焦显微镜图像分析、发育生物学及医学图像处理研究。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
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数据说明
该数据集包含多个原始胰腺共聚焦显微镜四维(x, y, z, 时间)灰度图像堆栈,每个图像均采集自体外发育的胚胎器官。每个视野仅包含胰腺的一部分,部分图像来自同一生物样本。记录的信号对应发育中胰腺导管的管状结构,导管细胞顶端区域通过红色荧光蛋白mCherry(与MUCIN1蛋白基因融合)进行可视化。原始图像以2D切片形式提供以便处理。数据集还包括从原始图像中提取的较小图像块及其对应的胰腺导管二进制人工标注。这些初始的3D图像块同样以2D切片(图像和掩码)形式提供。此外,提供简单的Python脚本用于在2D排列与原始3D版本之间转换。数据适用于胰腺导管分割、共聚焦显微镜图像分析、发育生物学及医学图像处理研究。
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