同一囊性纤维化中心儿童间铜绿假单胞菌交叉传播研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT03910920

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：囊性纤维化、铜绿假单胞菌、交叉感染。囊性纤维化是高加索人群中最为常见的遗传性常染色体隐性遗传病。该病由编码CFTR蛋白（囊性纤维化跨膜传导调节因子）的基因突变引起，CFTR是一种存在于上皮细胞顶端的离子通道。通道功能障碍导致水合不足及多种外分泌分泌物黏稠度增高。临床上，囊性纤维化是一种多系统疾病，肺部和胰腺受累通常最为突出。呼吸功能减退，伴随急性和慢性感染，是发病和死亡的主要原因。铜绿假单胞菌是一种普遍存在的革兰阴性杆菌，主要存在于死水中。铜绿假单胞菌能够定植于消化道、肺部和泌尿道黏膜以及皮肤。该细菌涉及多种机会性感染，包括囊性纤维化患者的呼吸道感染。铜绿假单胞菌感染是囊性纤维化群体中最常见的肺实质感染。

铜绿假单胞菌慢性携带是预后不良的因素，与发病率和死亡率增加相关。与铜绿假单胞菌慢性携带相关的并发症，为实施清除、筛查和根除急性铜绿假单胞菌感染策略提供了依据。除患者通过环境受到铜绿假单胞菌污染外，囊性纤维化患者之间已有手部和空气传播感染的报道。因此，大多数医院已实施消除交叉传播的措施。本研究的目的首先在于确定在HUDERF囊性纤维化中心随访的囊性纤维化患者之间铜绿假单胞菌交叉传播的数量。研究者将使用脉冲场凝胶电泳来评估

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。