气道菌群失调加速COPD肺功能下降（小鼠UPLC-MS/MS检测）

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS6894

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

进行性肺功能下降是慢性阻塞性肺疾病（COPD）的标志性特征。气道菌群失调在COPD中发生，但其是否促进疾病进展仍不清楚。在此，我们通过对涉及英国四个中心的两个队列进行纵向分析表明，COPD患者基线气道菌群失调以机会致病性分类群富集为特征，与两年内一秒用力呼气容积（FEV1）快速下降相关。该菌群失调与急性加重相关的FEV1下降以及稳定期FEV1骤降相关，共同导致长期FEV1下降。微生物群-FEV1下降的关联在中国第三个队列中得到验证。人类多组学和小鼠研究表明，气道金黄色葡萄球菌定植通过同型半胱氨酸促进肺功能下降，同型半胱氨酸通过AKT1-S100A8/A9轴引发中性粒细胞从凋亡向NETosis的转变。通过噬菌体清除金黄色葡萄球菌可恢复肺气肿小鼠的肺功能，为通过靶向气道微生物组减缓COPD进展提供了新途径。关联研究：本研究报道了小鼠样本的UPLC-MS/MS检测。

人类样本的UPLC-MS/MS检测结果报告于MTBLS5423。原始队列人类样本的UPLC-MS/MS检测结果报告于MTBLS4017。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。