GNPS 囊性纤维化痰液 GC 横断面数据
该数据集来自 omicsdi.org，收录囊性纤维化患者的痰液与漱口液样本，采用横断面方式采集，并提供 GC-MS 代谢组学数据
基本信息
资源简介
GNPS 囊性纤维化痰液 GC 横断面数据
GNPS GC Data XSectinoal CF Sputum 是一个面向囊性纤维化研究的代谢组学数据集，来源于 omicsdi.org，主题标签为 Metabolomics。该数据集收录了囊性纤维化患者的痰液与漱口液样本，样本以横断面方式采集，并提供气相色谱-质谱（GC-MS）数据。从分类上看，它归属于呼吸道疾病下的囊性纤维化方向，适合关注囊性纤维化气道代谢特征的研究者参考使用。整体而言，该数据集的核心价值在于将囊性纤维化患者的呼吸道样本与 GC-MS 代谢组学检测结果相结合，为相关代谢谱分析和比较研究提供数据基础。
【数据集背景】
囊性纤维化是一种累及呼吸系统的疾病，患者气道分泌物常成为代谢组学研究的重要样本来源。该数据集以囊性纤维化患者为对象，围绕痰液和漱口液两类样本组织数据，属于代谢组学主题下的资源。其英文名称中的“XSectinoal”对应横断面采集的设计思路，即在同一时间截面上收集样本，而非纵向随访。数据集来源于 omicsdi.org，本站将其归入呼吸道疾病 / 囊性纤维化分类，便于在呼吸系统疾病相关资源中检索和定位。
【数据内容】
数据集包含囊性纤维化患者的痰液样本与漱口液样本，检测手段为 GC-MS，产出的是代谢组学数据。痰液可反映气道内的代谢物组成，漱口液则提供口腔来源的样本类型，两者共同构成该数据集的样本内容。数据主题标签为 Metabolomics，说明其组织与描述围绕代谢组学展开。除上述样本类型与检测技术外，源站未提供关于代谢物数量、样本数量、文件格式或具体检测参数等更细化的信息。
【采集与来源】
样本采集对象为囊性纤维化患者，采集方式为横断面采集，样本类型包括痰液和漱口液。数据来源站为 omicsdi.org，该数据集即通过这一平台发布和索引。源站描述明确提到样本来自囊性纤维化患者，并以横断面方式收集，同时强调数据为 GC-MS 数据。关于采集地点、采集时间、伦理审批信息以及样本处理流程等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于囊性纤维化相关的代谢组学探索，例如比较患者痰液与漱口液样本的 GC-MS 代谢特征，或作为呼吸道疾病代谢研究的参考数据。由于样本以横断面方式采集，适合用于横断面性质的代谢谱描述与样本间比较，而不适用于纵向变化分析。对于关注囊性纤维化气道代谢物、口腔样本代谢组成的研究方向，该数据集可作为数据来源之一。具体的研究设计适配性仍需结合源站信息进一步判断。
【使用方法】
该数据集通过 omicsdi.org 提供，使用者可前往该来源站检索并获取数据。使用时应注意其样本类型为痰液与漱口液、检测平台为 GC-MS、采集设计为横断面，从而在分析中合理界定研究问题。关于数据下载方式、文件组织格式、预处理步骤及分析工具等操作层面的说明，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为囊性纤维化患者的痰液与漱口液 GC-MS 代谢组学数据，样本采集为横断面设计，因此不包含纵向随访信息。源站描述较为简短，未提供样本量、代谢物鉴定数量、数据完整性与质控指标等信息，使用前需自行评估数据是否满足研究需求。此外，痰液与漱口液属于不同样本类型，分析时应注意区分其来源与代谢背景。关于数据质量评价与已知局限性，源站未提供更多内容。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可条款，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前，应自行向来源站 omicsdi.org 核实相关引用要求与使用许可。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/gnps/MSV000081150
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
A collection of sputum and mouth rinse samples from cystic fibrosis patients collected cross sectionally. GC-MS data!!
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
