GNPS 药物代谢演示数据

该数据集来自 omicsdi.org,为 GNPS 药物代谢演示数据,收录囊性纤维化患者的痰样本,用于展示 sulfamethoxazole、voriconazole 和 azithromycin 三种药物的代谢情况

omicsdi
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时间序列Metabolomics
GNPS Drug Metabolism Demo Data

基本信息

模态
时间序列
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

GNPS 药物代谢演示数据

GNPS Drug Metabolism Demo Data 是一套以药物代谢演示为核心目标的代谢组学数据集,来源于 omicsdi.org,在分类上归入呼吸道疾病下的囊性纤维化方向。该数据集收录囊性纤维化患者的痰样本,用于展示 sulfamethoxazole、voriconazole 与 azithromycin 三种药物在真实生物样本中的代谢情况。作为 GNPS 平台相关的演示数据,它的价值在于把药物代谢这一分析主题与囊性纤维化呼吸道样本这一具体临床场景结合起来,使研究者能够在同一份数据中观察多种药物在痰液基质中的代谢表现。数据集以 Metabolomics 为主题标签,整体定位偏向方法演示与示例参考,而非大规模队列研究。

【数据集背景】

囊性纤维化是一种累及呼吸系统的疾病,患者常因反复感染而接受多种药物治疗,痰液因此成为观察药物及其代谢产物的重要生物样本。该数据集正是在这一背景下构建,目的是通过囊性纤维化患者的痰样本展示药物代谢分析流程。源站描述明确指出,这是一套用于演示 sulfamethoxazole、voriconazole 和 azithromycin 三种药物代谢情况的数据,属于 GNPS 药物代谢演示数据。其分类归属为呼吸道疾病 / 囊性纤维化,主题标签为 Metabolomics,说明该数据在学科上属于代谢组学范畴,在应用上服务于呼吸系统疾病相关研究。

【数据内容】

数据集的核心内容是来自囊性纤维化患者的痰样本,围绕 sulfamethoxazole、voriconazole 和 azithromycin 三种药物的代谢展开。源站描述强调其用途是“demonstrates drug metabolism”,即展示上述药物的代谢情况,因此数据内容的重心在于药物代谢相关信号,而非全面的代谢物普查。样本类型为痰样本,基质具有呼吸道分泌物的典型特征。关于样本数量、代谢物鉴定数量、具体代谢产物名称等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自 omicsdi.org,英文名称为 GNPS Drug Metabolism Demo Data。源站描述仅说明样本为囊性纤维化患者的痰样本,未提供采样地点、采样时间、患者人口学信息、用药剂量与采样时间关系等细节。数据由 GNPS 相关体系以演示数据形式发布,具体采集机构与采集流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于药物代谢分析方法的演示与教学,也适合作为囊性纤维化痰样本代谢组学分析的示例数据。研究者可借助它了解如何在痰液这类复杂基质中考察 sulfamethoxazole、voriconazole 和 azithromycin 的代谢表现,并可将分析流程迁移至类似的呼吸道样本研究。由于定位为演示数据,它更适合用于方法验证、流程展示与结果对照,而非直接支撑临床结论。具体可支持的统计分析与比较设计,源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时,可围绕药物代谢这一主题,对痰样本中与上述三种药物相关的代谢信号进行观察与展示。由于数据以演示为目的,建议将其作为分析流程的示例输入,用于验证代谢物识别、药物代谢产物筛查等环节的操作可行性。关于数据文件格式、预处理步骤、参数设置与推荐分析工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为演示性质,样本来源限定为囊性纤维化患者的痰样本,覆盖的药物仅为 sulfamethoxazole、voriconazole 和 azithromycin 三种,因此在外推至其他药物、其他基质或其他人群时需谨慎。关于样本量、数据完整性、缺失值情况、定量准确性与重复性等质量指标,源站未提供。使用者应将其视为方法演示材料,而非具有群体代表性的参考数据集。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议与使用条款,源站未提供。使用前建议前往 omicsdi.org 对应条目核实相关说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/gnps/MSV000081098

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

一组来自囊性纤维化患者的痰样本,展示了磺胺甲噁唑、伏立康唑和阿奇霉素的药物代谢。

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