正常痰液蛋白质组的大规模HDMSE图谱
该数据集来自 omicsdi.org,主题为正常痰液蛋白质组的大规模HDMSE图谱,属于呼吸系统疾病/哮喘分类。源站描述指出,该研究属于U-BIOPRED项目,旨在通过诱导痰的蛋白质组指纹刻画重度哮喘患者,并判断能否识别重度哮喘亚组,同时探究亚组间存在差异的生物学通路

基本信息
资源简介
正常痰液蛋白质组的大规模HDMSE图谱
该数据集来自 omicsdi.org,主题为正常痰液蛋白质组的大规模HDMSE图谱,属于呼吸系统疾病/哮喘分类。数据基于Label free、Data independent采集方式,样本为人痰液。源站描述指出,该研究属于U-BIOPRED项目,旨在通过诱导痰的蛋白质组指纹刻画重度哮喘患者,并判断能否识别重度哮喘亚组,同时探究亚组间存在差异的生物学通路。该数据集可用于重度哮喘亚型分类、痰液蛋白质组特征分析及相关生物标志物研究(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):重度哮喘是一组具有不同病理生理特征的疾病实体,可导致咳嗽、喘息和呼吸困难等症状,并频繁急性加重。为解决表型差异和异质性问题,无偏生物标志物预测呼吸系统疾病结局(U-BIOPRED)项目作为创新药物计划(IMI)框架内的公私合作项目而设立,汇集了学术界、制药行业和患者群体。本研究的目的是识别诱导痰中的蛋白质组指纹,以刻画重度哮喘患者,并确定能否识别重度哮喘的亚组。此外,我们还有兴趣阐明亚组之间表现出差异的生物学通路。该数据集是对正常痰液的描述
【主题与分类】
主题标签:Label free、Data independent、Human、Sputum。本站分类:呼吸系统疾病/哮喘。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD005949
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD005949
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
重度哮喘是一组具有不同病理生理特征的疾病实体,导致咳嗽、喘息和呼吸困难等症状,并频繁急性发作。为了解决表型差异和异质性问题,在创新药物倡议(IMI)框架内,作为公私合作伙伴关系,启动了呼吸系统疾病结局预测的无偏生物标志物(U-BIOPRED)项目,吸引了学术界、制药行业和患者团体的参与。本研究的目的是识别诱导痰中的蛋白质组指纹,以表征重度哮喘患者,并确定是否可以识别出重度哮喘的亚组。此外,我们感兴趣的是阐明亚组之间显示出差异的生物学途径。本数据集是对正常痰蛋白质组的描述。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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