PXD002600:TKI耐药肾细胞癌细胞的蛋白表达

酪氨酸激酶抑制剂耐药是肾癌靶向治疗的重要问题。本研究关注阿昔替尼和索拉非尼耐药的分子背景,从标准二维单层细胞培养一开始以及三维模型(软琼脂和悬浮培养)中观察,耐药仅见于市售人肾癌细胞干细胞

pride
2018-01-02 更新
浏览 41
蛋白质分类Kidney cancerStem cellMass spectrometryLabel free
PXD002600: Protein expression in TKI-resistant RCC cells.

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2018-01-02

资源简介

PXD002600:TKI耐药肾细胞癌细胞的蛋白表达

酪氨酸激酶抑制剂耐药是肾癌靶向治疗的重要问题。本研究关注阿昔替尼和索拉非尼耐药的分子背景,从标准二维单层细胞培养一开始以及三维模型(软琼脂和悬浮培养)中观察,耐药仅见于市售人肾癌细胞干细胞。质谱分析揭示若干蛋白,可能与常氧下阿昔替尼耐药及缺氧下索拉非尼耐药功能相关。涉及肾癌、干细胞、质谱、无标记及人源样本(来源 ebi.ac.uk)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):酪氨酸激酶抑制剂耐药是肾癌靶向治疗面临的一个重要问题。本研究聚焦于在标准二维单层细胞培养最初阶段以及三维模型(软琼脂和悬浮培养)中观察到的阿昔替尼和索拉非尼耐药的分子背景。耐药仅见于市售的人肾癌干细胞。质谱分析发现了几种蛋白质,这些蛋白质可能在功能上与常氧条件下对阿昔替尼的耐药以及缺氧条件下对索拉非尼的耐药有关。

【主题与分类】

主题标签:Kidney cancer、Stem cell、Mass spectrometry、Label free。本站分类:肿瘤/肾癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD002600

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数据说明

酪氨酸激酶抑制剂耐药是肾癌靶向治疗面临的一个重要问题。本研究聚焦于在标准二维单层细胞培养最初阶段以及三维模型(软琼脂和悬浮培养)中观察到的阿昔替尼和索拉非尼耐药的分子背景。耐药仅见于市售的人肾癌干细胞。质谱分析发现了几种蛋白质,这些蛋白质可能在功能上与常氧条件下对阿昔替尼的耐药以及缺氧条件下对索拉非尼的耐药有关。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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