GNPS 哮喘队列粪便样本代谢组学
该数据集来自 GNPS,为哮喘队列的粪便样本非靶向 LC/MS 代谢组学数据,样本由 Microbiome Core 采集

基本信息
资源简介
GNPS 哮喘队列粪便样本代谢组学
GNPS - Asthma Cohort Fecal Samples Metabolomics 是一个面向哮喘研究的代谢组学数据集,其英文名称已明确指向 GNPS 平台与哮喘队列粪便样本的关联。该数据集在分类上归属于呼吸系统疾病中的哮喘方向,来源站为 omicsdi.org。根据源站描述,该数据集的核心内容是对哮喘队列粪便样本开展的非靶向 LC/MS 代谢组学分析,相关样本由 Microbiome Core 采集。数据集的主题标签为 Metabolomics,侧写线索进一步概括为:该数据集来自 GNPS,为哮喘队列的粪便样本非靶向 LC/MS 代谢组学数据,样本由 Microbiome Core 采集。整体而言,该数据集围绕哮喘这一呼吸系统疾病,以粪便样本为对象,采用非靶向液相色谱-质谱联用技术获取代谢组学信息,适合用于探索哮喘与肠道代谢物之间可能存在的关联。
【数据集背景】
该数据集归属于呼吸系统疾病中的哮喘研究方向。哮喘是一种常见的慢性呼吸系统疾病,其发生发展可能与多种环境与宿主因素相关。该数据集以哮喘队列为研究对象,关注粪便样本的代谢组学特征,旨在从代谢层面为哮喘相关研究提供数据支撑。数据集的来源站为 omicsdi.org,其英文名称中包含 GNPS 与 Asthma Cohort Fecal Samples Metabolomics 等关键信息,表明其与 GNPS 平台以及哮喘队列粪便样本代谢组学密切相关。主题标签为 Metabolomics,说明该数据集的核心学科领域为代谢组学。关于该数据集更具体的项目背景、研究假设或资助信息,源站未提供。
【数据内容】
该数据集的内容为哮喘队列粪便样本的非靶向 LC/MS 代谢组学数据。非靶向 LC/MS 代谢组学通常用于对样本中的代谢物进行较广泛的检测与分析,不预先限定目标代谢物范围。该数据集的主题标签为 Metabolomics,进一步明确了其数据类型属于代谢组学范畴。数据集英文名称中包含 Fecal Samples Metabolomics,表明其样本类型为粪便样本,数据内容围绕粪便样本的代谢组学展开。关于代谢物种类、检测到的特征数量、数据文件格式、数据量大小等具体细节,源站未提供。
【采集与来源】
根据源站描述,该数据集的粪便样本由 Microbiome Core 采集,采集对象为哮喘队列。样本采集后,采用非靶向 LC/MS 代谢组学方法进行分析。数据集的来源站为 omicsdi.org,英文名称中提及 GNPS,表明该数据集与 GNPS 存在关联。关于采集时间、采集地点、样本量、队列人群的具体特征、伦理审批信息等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与哮喘相关的代谢组学研究场景。由于其为粪便样本的非靶向 LC/MS 代谢组学数据,可用于探索哮喘队列中粪便代谢物的整体轮廓,也可用于与微生物组或其他组学数据开展关联分析。其主题标签为 Metabolomics,适合代谢组学领域的分析流程与方法开发。该数据集归属于呼吸系统疾病中的哮喘方向,因此也可用于呼吸系统疾病特别是哮喘相关的数据挖掘与假设生成。关于该数据集是否已被用于特定研究或是否适合某些具体分析流程,源站未提供。
【使用方法】
该数据集为 GNPS 相关的非靶向 LC/MS 代谢组学数据,通常可按照代谢组学数据的常规使用方式进行访问与处理。由于来源站为 omicsdi.org,用户可通过该来源站获取数据集的基本信息与访问入口。关于具体的数据下载方式、文件格式、预处理步骤、分析软件推荐或参数设置等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为非靶向 LC/MS 代谢组学数据,其检测范围较广,但非靶向方法在代谢物鉴定方面通常存在一定不确定性。该数据集基于哮喘队列的粪便样本,样本由 Microbiome Core 采集,其结论外推需谨慎。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应、技术重复或验证信息等,源站未提供。此外,该数据集是否包含临床元数据、是否经过标准化处理等,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 omicsdi.org,英文名称为 GNPS - Asthma Cohort Fecal Samples Metabolomics。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制或版权信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/gnps/MSV000091420
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
针对哮喘队列的粪便样本进行非靶向LC/MS代谢组学分析,该样本作为微生物组核心部分收集。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




