CF患者CHIT1基因重复与曲霉菌肺病风险

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT01572870

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：囊性纤维化，Chit1。标题：壳三糖苷酶（CHIT1）基因重复与囊性纤维化患者曲霉菌肺病风险。引言：几丁质酶是消化几丁质聚合物的酶。植物利用CHIT1作为对抗真菌的重要先天防御机制。CHIT1是人类气道中的主要几丁质酶。编码区变异，即24-bp重复等位基因，导致CHIT1活性降低。最近，在6/6名患有严重哮喘和真菌致敏的患者中发现了CHIT1重复。曲霉菌常持续存在于囊性纤维化（CF）患者的呼吸道中，并可能引起变应性支气管肺曲霉病（ABPA）。目的：评估CF患者中CHIT1重复与ABPA易感性或持续性曲霉菌感染之间的关联。患者：40名CF患者分为三组。第1组：过去既无ABPA也无曲霉菌感染的患者（对照组）。第2组：有持续性曲霉菌感染但无ABPA的患者。第3组：当前或既往有ABPA的患者。设计：观察性，单次访视。

方法：所有患者都将接受肺功能测试（PFT）、痰培养及血液检测，检测项目包括：CHIT1重复、IgE和嗜酸性粒细胞水平。患者特征，包括人口统计学信息、CF突变、胰腺状况和汗液测试结果，将从病历中获取。对于患有ABPA及曲霉菌感染的患者，还进行了霉菌的放射过敏吸附试验（RAST）、曲霉菌皮肤点刺试验以及血液半乳甘露聚糖检测。主要结局指标是两组间CHIT1基因分型的差异。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。