健康与哮喘气道上皮细胞的CompareRhythms数据

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A7ba886c4063239c31e588a666bcb49fd1c3200bd2b398fa7452790a2303ba9c5

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

理由：细胞昼夜节律调控多种细胞过程，并被认为影响哮喘中的上皮功能。哮喘患者的气道阻力存在昼夜变异性，但尚未对人类气道上皮基因表达的昼夜节律进行分析。在气液界面分化培养的原代人气道上皮细胞类器官培养物可重现人气道上皮的主要细胞类型，从而能够评估在体内无法实现的基因表达，并展示温度同步后核心昼夜节律基因的节律性。方法：来自6名健康儿童和6名哮喘儿童的原代人气管上皮细胞在气液界面分化，并使用循环培养箱温度同步昼夜节律。每4小时收集RNA并进行RNA测序以测量全转录组表达，鉴定出基因的差异节律性……，在择期手术全身麻醉期间，从受试者（6-16岁）获取健康儿童和医生诊断的过敏性哮喘儿童的气道上皮细胞。

AECs被扩增，并在第3代时于PneumaCult ALI培养基（Stemcell）中，在37°C下通过ALI进行分化，生成具有黏液纤毛形态的器官型分化上皮培养物。儿童AECs在经西雅图儿童医院机构审查委员会批准的研究#12490和#1596下获取，研究遵循1975年《赫尔辛基宣言》的规则进行。温度循环同步化持续6天（37°C下12小时，34°C下12小时），随后在RNA分离期间，培养物在恒定37°C下维持48小时。从最终换液和温度同步化完成后的4小时开始，每4小时收集一次RNA，持续48小时。每个时间点收集两个独立培养物用于RNA提取。样本wi

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。