一种遗传性mtDNA突变重塑巨噬细胞及体内炎症细胞因子反应

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256:06140d751366ccdce6dabc9d65f802d854ae073299b9b5aaa375adbe6e0482a0

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集旨在研究遗传性线粒体DNA（mtDNA）突变对巨噬细胞炎症反应的影响。数据集通过多组学方法整合了超分辨率成像、代谢分析和蛋白质组学数据，主要来源于携带m.5019A>G异质性突变（影响线粒体丙氨酸tRNA）的线粒体疾病小鼠模型中的巨噬细胞。数据内容包括RNA测序（RNA-seq）的原始fastq文件、基因表达计数矩阵（CPM）以及基于数据非依赖采集（DIA）的蛋白质组学定量数据（LFQ强度）。该数据集可用于探究线粒体功能障碍如何改变巨噬细胞的代谢适应、炎症激活（如LPS刺激后）以及细胞因子（如I型干扰素和促炎因子）和氧脂素的产生，主要研究方向包括线粒体疾病、免疫代谢、先天免疫及炎症性疾病机制。

数据加载示例（表格/文本类）

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))