中国患者中导致脊柱侧凸型埃勒斯-当洛斯综合征的新型PLOD1基因突变

该数据集包含一例中国脊柱侧凸型埃勒斯-当洛斯综合征患者的临床与基因数据,数据模态涵盖临床表格(如症状记录、检查结果)、基因序列(PLOD1突变信息)及影像资料(X光图像),主要用于研究罕见遗传性结缔组织病的基因突变特征、临床表现关联以及在中国人群中的首次病例分析,为疾病诊断与机制探索提供关键依据。

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2024-03-27 更新
浏览 38
Gene Mutation
A Novel PLOD1 Gene Mutation causing Kyphoscoliotic Ehlers-Danlos Syndrome in Chinese patient

基本信息

大小
0.003131531 GB
创建/更新时间
2024-03-27

资源简介

中国患者中导致脊柱侧凸型埃勒斯-当洛斯综合征的新型PLOD1基因突变

【数据集背景】

本数据集源站标题为《A Novel PLOD1 Gene Mutation causing Kyphoscoliotic Ehlers-Danlos Syndrome in Chinese patient》。源站首次发布:2020。

【数据内容】

源站原始描述:Kyphoscoliotic Ehlers-Danlos syndrome (kEDS) is a rare autosomal recessive connective tissue disorder characterized by progressive kyphoscoliosis, congenital muscular hypotonia, marked joint hypermobility, and severe skin hyperextensibility and fragility. Deficiency of lysyl hydroxylase 1 (LH1) due to mutations of PLOD1 (procollagen-lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1) gene has been identified as the pathogenic cause of kEDS (kEDS-PLOD1). Up to now, kEDS-PLOD1 has not been reported among Chin…

【主题与分类】

主题标签:Gene Mutation。

【获取与许可】

源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/r8kmp2tkv9/1

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源站:http://doi.org/10.17632/r8kmp2tkv9.1

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集记录了1例中国男性脊柱侧凸型埃勒斯-当洛斯综合征(Kyphoscoliotic Ehlers-Danlos Syndrome, kEDS)患者的临床与基因信息。数据集包含患者的临床表型描述(如肌张力低下、关节过度活动、脊柱侧凸、皮肤过度伸展与脆弱等)、影像学检查结果(X光显示严重脊柱侧凸与骨质疏松)以及基因分析数据。通过全外显子测序,发现患者携带PLOD1基因的新型纯合错义突变(c.1697 G>A, p.C566Y),并经生物信息学工具预测为致病性变异。该数据集为首次在中国人群报道的kEDS-PLOD1病例,为研究该罕见遗传性结缔组织病的基因型-表型关联、疾病机制与诊断提供了重要资料,适用于遗传病研究、临床诊断辅助及精准医疗等领域。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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